207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1581 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 215 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  74.88 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  74.88 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  74.88 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  74.88 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  73.43 
 
 		 210 aa  322  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  72.6 
 
 		 208 aa  317  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  76.81 
 
 		 211 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  76.33 
 
 		 211 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 		 220 aa  308  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  76.33 
 
 		 211 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  67.31 
 
 		 208 aa  299  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  64.9 
 
 		 209 aa  290  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  68.27 
 
 		 208 aa  284  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  69.12 
 
 		 209 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  74.36 
 
 		 161 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  28.92 
 
 		 416 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  32 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  31.5 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  31.5 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  31.5 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  31 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  30.35 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  29.74 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  28.27 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  27.04 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  28.92 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  24.87 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  26.02 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  21.78 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  26 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 428 aa  74.7  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 428 aa  74.7  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  25 
 
 		 428 aa  74.7  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  25.14 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  25.62 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.44 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  29 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  25.99 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  27.01 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  24.53 
 
 		 415 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  25.27 
 
 		 414 aa  71.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  27.98 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  27.98 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  24 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  27.98 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  27.98 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  27.98 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  24.55 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  22.6 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  26.84 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  26.23 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  30.27 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  26.27 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  27.11 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  23.62 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  24.31 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  26.11 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  25.43 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  20.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  24.76 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  24.76 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  24.75 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  24.76 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  24.76 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  24.76 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  27.98 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  23.76 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  25.49 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  23.11 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  23.11 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  27.32 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  23.27 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  27.87 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  23.11 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>