76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1555 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  61.28 
 
 		 592 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  62.08 
 
 		 596 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  61.41 
 
 		 594 aa  781    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  57.79 
 
 		 596 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  61.91 
 
 		 596 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  61.91 
 
 		 596 aa  800    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  58.72 
 
 		 594 aa  761    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  61.18 
 
 		 595 aa  786    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1222    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  59.6 
 
 		 604 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  61.14 
 
 		 595 aa  768    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  61.51 
 
 		 595 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  60.43 
 
 		 595 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  61.51 
 
 		 595 aa  791    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  62.48 
 
 		 596 aa  803    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  61.51 
 
 		 595 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  35.36 
 
 		 602 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  35.18 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  34.5 
 
 		 600 aa  329  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  32.69 
 
 		 601 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  32.25 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  32.25 
 
 		 586 aa  276  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  32.25 
 
 		 586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  31.43 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  29.84 
 
 		 595 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  31.47 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  31.47 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  31.11 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  31.11 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  31.11 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  31.47 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  31.27 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  30.88 
 
 		 593 aa  260  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  29.64 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  30.64 
 
 		 590 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  29.43 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  30.77 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  29.36 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  29.95 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  32.4 
 
 		 615 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  25.37 
 
 		 617 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  25.37 
 
 		 617 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  26.23 
 
 		 622 aa  198  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  26.7 
 
 		 613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  26.31 
 
 		 637 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.57 
 
 		 647 aa  187  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  26.18 
 
 		 638 aa  186  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  26.26 
 
 		 637 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  26.81 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  26.52 
 
 		 611 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.12 
 
 		 638 aa  174  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  24.96 
 
 		 635 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  25.63 
 
 		 609 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  24.09 
 
 		 607 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  23.82 
 
 		 607 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  28.22 
 
 		 625 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  25.29 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  32.59 
 
 		 509 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  28.75 
 
 		 508 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  24.66 
 
 		 624 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  26.62 
 
 		 641 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  24.67 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  25.05 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  23.33 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  23.06 
 
 		 621 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  22.88 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  21.23 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  23.08 
 
 		 630 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.73 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  23.19 
 
 		 429 aa  43.9  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>