150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1532 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  100 
 
 		 346 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  66.37 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  67.05 
 
 		 346 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  63.01 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  65.6 
 
 		 346 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  49.71 
 
 		 351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  47.23 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  45.51 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  44.91 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  44.91 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  44.51 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  45.21 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  44.21 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  43.9 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  44.28 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  44.61 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  44.21 
 
 		 331 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  44.21 
 
 		 331 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  44.91 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  43.9 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  43.47 
 
 		 334 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  44.31 
 
 		 335 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  44.31 
 
 		 335 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  43.9 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  44.61 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  43.9 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  43.6 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  41.72 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  40.18 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  39.7 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  41.62 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  38.07 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  37.43 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  39.64 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  37.35 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  40.42 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  34.94 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  36.75 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  33.63 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  33.63 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  33.53 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  33.93 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  34.64 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  35.65 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  33.53 
 
 		 345 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  34.74 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  33.53 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  33.23 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  33.23 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  33.23 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  35.05 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  34.14 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  32.94 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  33.54 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  33.54 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  33.23 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  31.38 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  34.15 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  34.15 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  31.82 
 
 		 337 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  33.23 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  33.23 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  33.03 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  30.86 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02121  proline racemase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02000)  35.31 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0070174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  32.94 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  32.63 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  32.08 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  30.15 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  32.56 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  32.42 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  31.29 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  31.71 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  32.24 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  29.63 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  34.21 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  32.34 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  30.37 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  31.02 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  30.72 
 
 		 348 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  31.44 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  31.74 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  29.88 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2499  proline racemase  32.73 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  30.18 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  29.13 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  32.73 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  30.39 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  29.94 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  33.63 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  31.4 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  30.33 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5220  4-hydroxyproline epimerase  32.53 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0432032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4122  hypothetical protein  32.54 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0159506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  28.7 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  29.09 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1044  proline racemase  31.93 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47840  hypothetical protein  32.24 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2705  proline racemase  31.74 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  31.72 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>