More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1488 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  59.52 
 
 
297 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  60.81 
 
 
297 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  60.81 
 
 
297 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  61.15 
 
 
297 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  60.47 
 
 
297 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  59.8 
 
 
297 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  61.15 
 
 
296 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  58.16 
 
 
299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  59.8 
 
 
296 aa  358  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  59.46 
 
 
296 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  59.46 
 
 
296 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  57.95 
 
 
307 aa  353  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  55.59 
 
 
297 aa  348  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  57.91 
 
 
304 aa  345  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  55.33 
 
 
301 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  57.91 
 
 
301 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  57.24 
 
 
301 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  57.05 
 
 
309 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  54.88 
 
 
302 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  56.57 
 
 
302 aa  328  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.57 
 
 
302 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  56.57 
 
 
302 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  57.24 
 
 
307 aa  325  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  55.89 
 
 
301 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  53.2 
 
 
297 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  53.2 
 
 
297 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  53.2 
 
 
297 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  53.2 
 
 
297 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  52.86 
 
 
297 aa  316  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  52.86 
 
 
297 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.53 
 
 
297 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.53 
 
 
297 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  52.86 
 
 
297 aa  315  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  53.2 
 
 
297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  48.8 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  50.33 
 
 
304 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  49 
 
 
304 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  48 
 
 
301 aa  288  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  50.99 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  49.33 
 
 
300 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  49.33 
 
 
309 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  45.95 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.3 
 
 
301 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  46.64 
 
 
296 aa  255  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  47.32 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  42.44 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  43.51 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  43.51 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  42.48 
 
 
306 aa  242  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  42.05 
 
 
302 aa  241  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  45.97 
 
 
300 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  42.86 
 
 
307 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  44.92 
 
 
309 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  45.64 
 
 
300 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  47.16 
 
 
300 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  43.28 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  42.72 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  46.98 
 
 
298 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  40.13 
 
 
320 aa  232  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  44.77 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
301 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  42.62 
 
 
308 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  42.72 
 
 
309 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  42.62 
 
 
308 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  41.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  42.86 
 
 
299 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  41.97 
 
 
308 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  46.84 
 
 
295 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  42.76 
 
 
464 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.52 
 
 
501 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
301 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  42.91 
 
 
499 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  45.33 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  39.48 
 
 
310 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  42.81 
 
 
313 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  42.57 
 
 
499 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  42.57 
 
 
499 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  42.57 
 
 
499 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  41.83 
 
 
313 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  42.57 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  40.6 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  48 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47 
 
 
307 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  38.93 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2361  hypothetical protein  42.81 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  38.93 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  44.78 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  38.59 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  38.93 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  39.8 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  43.28 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  40.38 
 
 
316 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  38.59 
 
 
301 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>