48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1398 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  67.42 
 
 		 273 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  68.32 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  66.92 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  65.27 
 
 		 274 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  64.12 
 
 		 274 aa  380  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  64.39 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  64.5 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  64.12 
 
 		 274 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  64.02 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  63.74 
 
 		 274 aa  377  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  63.64 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  64.02 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  63.36 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  62.45 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  62.98 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  64.62 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  63.22 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  61.45 
 
 		 275 aa  358  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  59.18 
 
 		 283 aa  338  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  54.37 
 
 		 267 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  55.73 
 
 		 278 aa  309  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  52.47 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  52.85 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  53.03 
 
 		 266 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  53.03 
 
 		 266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  54.18 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  52.99 
 
 		 265 aa  298  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  50.19 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  50.79 
 
 		 276 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  50.39 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  50.39 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  49.03 
 
 		 274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  48.69 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  49.43 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  42.91 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  42.91 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  38.37 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  38.85 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  37.3 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  35.8 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  23.28 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  27.66 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  27.59 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  25.11 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  24.23 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  25.13 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>