129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1396 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 
884 aa  1800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  59.03 
 
 
912 aa  1068    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03791  glycosyl hydrolase, family 16  61.23 
 
 
437 aa  499  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000024164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  48.41 
 
 
1918 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  35.91 
 
 
694 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  49.3 
 
 
358 aa  344  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  48.37 
 
 
532 aa  328  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.07 
 
 
742 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.03 
 
 
328 aa  249  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.31 
 
 
306 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  42.28 
 
 
291 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
1321 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  38.77 
 
 
731 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  36.49 
 
 
883 aa  200  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.54 
 
 
315 aa  195  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  36.65 
 
 
328 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  42.66 
 
 
276 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 
301 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.89 
 
 
1694 aa  181  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  37.39 
 
 
503 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  38.93 
 
 
286 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.15 
 
 
423 aa  168  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 
641 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 
642 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  38.67 
 
 
289 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  39.86 
 
 
274 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  36.7 
 
 
286 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  38.93 
 
 
291 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  36.76 
 
 
279 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.29 
 
 
633 aa  161  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.86 
 
 
1332 aa  157  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  34.71 
 
 
1028 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.46 
 
 
1290 aa  152  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  35.19 
 
 
330 aa  151  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  35.14 
 
 
281 aa  149  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 
469 aa  147  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.79 
 
 
282 aa  146  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.77 
 
 
288 aa  144  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  37.02 
 
 
283 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  35.52 
 
 
556 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.72 
 
 
252 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.55 
 
 
627 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.38 
 
 
383 aa  134  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  33.66 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.22 
 
 
426 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.22 
 
 
389 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 
384 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  37.96 
 
 
1426 aa  126  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  25.05 
 
 
1059 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  33.11 
 
 
588 aa  120  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  38.96 
 
 
1441 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.85 
 
 
547 aa  120  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.15 
 
 
819 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.91 
 
 
261 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  34.77 
 
 
238 aa  118  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.38 
 
 
569 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.94 
 
 
290 aa  116  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
346 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  30.65 
 
 
313 aa  115  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  33.9 
 
 
269 aa  112  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  33.69 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.71 
 
 
722 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
449 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
752 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
260 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.74 
 
 
286 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 
427 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  29.74 
 
 
275 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  28.28 
 
 
277 aa  98.2  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 
394 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  30.84 
 
 
470 aa  95.9  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  32.98 
 
 
467 aa  95.5  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  27.58 
 
 
477 aa  91.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 
405 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  28.38 
 
 
319 aa  90.5  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 
465 aa  89.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 
320 aa  88.6  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  27.13 
 
 
475 aa  87  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.97 
 
 
263 aa  86.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  30.37 
 
 
479 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 
907 aa  84  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.29 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  27.98 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.27 
 
 
1007 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  28.98 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  29.71 
 
 
464 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 
686 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
306 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.71 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 
308 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 
277 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  33.17 
 
 
256 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  24.13 
 
 
877 aa  69.7  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.58 
 
 
639 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  26.28 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  26.16 
 
 
388 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 
492 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  27.86 
 
 
337 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.14 
 
 
915 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>