41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1254 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  87.69 
 
 		 260 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  87.69 
 
 		 260 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  87.31 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  87.31 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  86.92 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  86.92 
 
 		 260 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  86.92 
 
 		 260 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  86.54 
 
 		 260 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  83.08 
 
 		 260 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  83.85 
 
 		 260 aa  447  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  82.69 
 
 		 260 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  80.77 
 
 		 260 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  77.69 
 
 		 260 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  85.91 
 
 		 221 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  46.46 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  46.09 
 
 		 259 aa  254  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  37.05 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  43.06 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  36.92 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  35.63 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  34.15 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  34.15 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  33.73 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  33.33 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  35.77 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  34.93 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  31.75 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  33.06 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  36.16 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  50.42 
 
 		 118 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  31.67 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  30.92 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  29.56 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  37.04 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.48 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  23.92 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  31.13 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  30.22 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>