196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1196 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  100 
 
 
397 aa  813    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  54.14 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  53.59 
 
 
386 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  53.59 
 
 
386 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  47.41 
 
 
388 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  45.33 
 
 
387 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  45.04 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  45.04 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  45.04 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  45.04 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  45.04 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  45.04 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  45.04 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  45.04 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  38.4 
 
 
395 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  38.08 
 
 
395 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  43.62 
 
 
380 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  42.25 
 
 
384 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  39.89 
 
 
390 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  39.63 
 
 
390 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  43.6 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  36.98 
 
 
384 aa  276  5e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  37.33 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  41.64 
 
 
388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  41.64 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  41.64 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  37.33 
 
 
388 aa  264  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  35.71 
 
 
376 aa  259  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  37.2 
 
 
377 aa  252  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  37.33 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  35.19 
 
 
388 aa  229  5e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  31.56 
 
 
400 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.54 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  30.59 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  27.27 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  26.21 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.48 
 
 
586 aa  64.3  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5508  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.46 
 
 
608 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
608 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.75 
 
 
606 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.59 
 
 
608 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.93 
 
 
330 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16620  predicted phosphosugar isomerase  28.45 
 
 
294 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.816556  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.58 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  26.35 
 
 
329 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.74 
 
 
353 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3375  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.93 
 
 
608 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2584  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.4 
 
 
616 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.946253  normal  0.069617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
608 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.89 
 
 
612 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.89 
 
 
612 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
608 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
608 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2057  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
608 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.77 
 
 
606 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.53 
 
 
607 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  23.77 
 
 
309 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.82 
 
 
609 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.82 
 
 
609 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.82 
 
 
609 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.14 
 
 
609 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.81 
 
 
609 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.54 
 
 
608 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1020  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.25 
 
 
608 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0684  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.17 
 
 
601 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.430395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0903  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.86 
 
 
602 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.82 
 
 
611 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.96 
 
 
607 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.2 
 
 
613 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.27 
 
 
609 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.9 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.89 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.89 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.89 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
607 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1404  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.5 
 
 
608 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247017  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.55 
 
 
610 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0557  glutamine amidotransferase class-II  24.52 
 
 
595 aa  50.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217715 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.57 
 
 
611 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.65 
 
 
608 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  27.57 
 
 
611 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.54 
 
 
608 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316108  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4910  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.29 
 
 
608 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  25.09 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.09 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1202  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.49 
 
 
607 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10337  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  25.09 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.62 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.27 
 
 
613 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  23.66 
 
 
610 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.41 
 
 
608 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487309  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
604 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
604 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>