More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1099 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  564  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  48.25 
 
 
295 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  45.3 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  44.68 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  44.22 
 
 
310 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  44.04 
 
 
308 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  43.38 
 
 
308 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  43.38 
 
 
308 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  44.07 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.2 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  43.05 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  43.05 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.49 
 
 
310 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  40.86 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  42.76 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.23 
 
 
308 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  43.05 
 
 
310 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  43.43 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  43.43 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  40.55 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  40.75 
 
 
302 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  43.1 
 
 
310 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  43.1 
 
 
310 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  43.1 
 
 
310 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  42.05 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  39.67 
 
 
322 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  42.4 
 
 
295 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  37.04 
 
 
335 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.19 
 
 
324 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  37.16 
 
 
298 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  37.62 
 
 
310 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  38.31 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.35 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  34.11 
 
 
294 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
303 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  41.98 
 
 
301 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  39.57 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  39.79 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  39.05 
 
 
303 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  37.55 
 
 
311 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  35.86 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  31.14 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  36.16 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  37.54 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  36.4 
 
 
296 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 
301 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  34.36 
 
 
311 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  34.6 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  35.79 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  40.99 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  35.98 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  34.18 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  36.7 
 
 
291 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  34.65 
 
 
364 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  36.7 
 
 
291 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  36.36 
 
 
314 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  34.16 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.52 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.64 
 
 
283 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.81 
 
 
312 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  32.21 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  36.03 
 
 
356 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  30.69 
 
 
298 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  31.01 
 
 
314 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  35.76 
 
 
319 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 
306 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 
320 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  32.88 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  32.77 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  32.86 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.26 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  33.46 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  32.39 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  47.11 
 
 
119 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.11 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.09 
 
 
321 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 
309 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  32.62 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.38 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  32.04 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  32.43 
 
 
320 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  30.04 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  28.52 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.97 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  32.47 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  29.02 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.12 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>