101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1061 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  43.79 
 
 		 770 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  43.98 
 
 		 769 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  44.58 
 
 		 769 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  44.71 
 
 		 770 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1568    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  42.88 
 
 		 770 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  42.56 
 
 		 770 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  42.88 
 
 		 770 aa  674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  41.85 
 
 		 769 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  42.75 
 
 		 770 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  40.6 
 
 		 772 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  24.72 
 
 		 691 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  26 
 
 		 519 aa  126  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  29.33 
 
 		 621 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.12 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  24.83 
 
 		 534 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  27.98 
 
 		 454 aa  96.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.48 
 
 		 291 aa  92.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  25.85 
 
 		 580 aa  90.1  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  25.85 
 
 		 449 aa  87.4  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  26.09 
 
 		 566 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  26.49 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  27.03 
 
 		 720 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  26.84 
 
 		 720 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  26.12 
 
 		 327 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  26.84 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.14 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.1 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  23.56 
 
 		 722 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  23 
 
 		 722 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  23.29 
 
 		 722 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  23.29 
 
 		 722 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  24.44 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  24.38 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  24.34 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  31.5 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  26.37 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  23.35 
 
 		 424 aa  72  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  23.48 
 
 		 566 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  25.63 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  29.92 
 
 		 175 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  32.69 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  24.15 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  22.8 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  29.59 
 
 		 755 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  23.55 
 
 		 576 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  29.13 
 
 		 175 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  29.59 
 
 		 755 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  25.66 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  34.95 
 
 		 178 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  28.77 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29.52 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  34.95 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  26.97 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  32.46 
 
 		 171 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  22.59 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  28.29 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  22.67 
 
 		 829 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  26.1 
 
 		 838 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  32.48 
 
 		 181 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  22.6 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  22.46 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  23.21 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  25.74 
 
 		 838 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  22.34 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  24.72 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  22.59 
 
 		 829 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  27.56 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  23.86 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  25.74 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  23.26 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  22.87 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  23.39 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  23.26 
 
 		 576 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  23.27 
 
 		 571 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  27.53 
 
 		 180 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  25.06 
 
 		 818 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  55.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  27.56 
 
 		 203 aa  55.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  22.17 
 
 		 828 aa  55.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  27.89 
 
 		 351 aa  54.7  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  23.32 
 
 		 197 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.11 
 
 		 590 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  25 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  21.92 
 
 		 816 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  22.61 
 
 		 816 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5145  MORN variant repeat protein  30.94 
 
 		 199 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  20.88 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  29.46 
 
 		 187 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  21.27 
 
 		 684 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  22.36 
 
 		 816 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3096  MORN variant repeat protein  33.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.102231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 351 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  25.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  26.04 
 
 		 468 aa  47.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  24.68 
 
 		 203 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  23.92 
 
 		 351 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1108  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000270207  hitchhiker  0.00000000131688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>