More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1049 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1049  aspartate kinase  100 
 
 
403 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00683315  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3427  aspartokinase  57.42 
 
 
418 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1199  aspartate kinase  58.15 
 
 
418 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000597152  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2744  aspartate kinase  56.93 
 
 
418 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00631887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1128  aspartate kinase  57.42 
 
 
418 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000633865  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1129  aspartate kinase  57.42 
 
 
418 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3114  aspartate kinase  57.18 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000131076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3266  aspartate kinase  57.18 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00158192  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3123  aspartate kinase  57.18 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00206455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1251  aspartate kinase  57.18 
 
 
418 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000231974  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  46.4 
 
 
413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  46.04 
 
 
409 aa  338  7e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  46.27 
 
 
411 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  46.27 
 
 
411 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  46.9 
 
 
412 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  46.17 
 
 
408 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  46.02 
 
 
411 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  46.02 
 
 
410 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  46.02 
 
 
410 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  45.77 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  45.77 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  45.91 
 
 
424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  45.19 
 
 
413 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  46.67 
 
 
413 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  47.88 
 
 
410 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  45.66 
 
 
412 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  45.02 
 
 
409 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  45.59 
 
 
408 aa  319  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  45.66 
 
 
412 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  46.38 
 
 
414 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  42.14 
 
 
428 aa  316  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  42.17 
 
 
427 aa  315  8e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  42.14 
 
 
428 aa  315  9e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  44.33 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  43.56 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  45.64 
 
 
416 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  44.34 
 
 
422 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  44.78 
 
 
409 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  44.34 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  42.36 
 
 
408 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  40.3 
 
 
427 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  44.09 
 
 
409 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  42.25 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  41.79 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  45.14 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  45.14 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  44.82 
 
 
422 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  44.82 
 
 
422 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  44.82 
 
 
422 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  43.5 
 
 
410 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  45.32 
 
 
421 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  44.5 
 
 
422 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  41.97 
 
 
416 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  40.94 
 
 
409 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  44.44 
 
 
416 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  40.6 
 
 
405 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  43.17 
 
 
422 aa  295  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  40.3 
 
 
403 aa  295  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  41.29 
 
 
411 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  44.26 
 
 
453 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  44.06 
 
 
410 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  44.15 
 
 
422 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  40.45 
 
 
404 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  42.33 
 
 
409 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  44.07 
 
 
416 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  41.35 
 
 
405 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  42.25 
 
 
404 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  41.85 
 
 
417 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  40.25 
 
 
400 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  41.01 
 
 
417 aa  290  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  40.85 
 
 
407 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  40.74 
 
 
400 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  42.17 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  42.17 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  42.17 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  42.17 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  41.93 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  42.17 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  41.93 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  42.17 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  43.8 
 
 
416 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  43.8 
 
 
416 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  41.21 
 
 
404 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  40.95 
 
 
404 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  41.09 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  41.79 
 
 
408 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  43.2 
 
 
416 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  40.49 
 
 
400 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  43.18 
 
 
409 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  42.41 
 
 
423 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  42.11 
 
 
405 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  44.09 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  41.01 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  42.42 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  41.73 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  43.25 
 
 
407 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  41.79 
 
 
417 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  41.79 
 
 
417 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  41.79 
 
 
417 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  41.79 
 
 
416 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>