66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0994 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  81.78 
 
 		 461 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  79.91 
 
 		 443 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  79.78 
 
 		 451 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  80.31 
 
 		 452 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  74.67 
 
 		 463 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  898    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  80.75 
 
 		 452 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  80.31 
 
 		 452 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  74.5 
 
 		 450 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  80.09 
 
 		 452 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  80.31 
 
 		 452 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  80.67 
 
 		 451 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  72.06 
 
 		 452 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  80.31 
 
 		 452 aa  708    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  80.31 
 
 		 452 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  80.22 
 
 		 451 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  78.98 
 
 		 452 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  69.79 
 
 		 438 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  68.1 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  70.02 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  67.73 
 
 		 458 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  57.33 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  57.33 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  52.13 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  45.9 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  53.2 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  49.67 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  44.05 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  49.21 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  44.62 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  44.62 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  43.31 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  30.89 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  32.01 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  32.01 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  32.01 
 
 		 442 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  31.52 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  32.17 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  31.29 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  31.35 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  30.2 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  30.02 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  31.29 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  30.7 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  31.52 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  32.48 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  29.45 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  32.87 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  31.89 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  31.74 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  28.85 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  28.85 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  30.6 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  27.48 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  31.79 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  27.07 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  31.06 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  28.92 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  28.47 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  26.95 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  25.57 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  24.39 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  31.91 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  32.99 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  21.9 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  31.31 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>