20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0972 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  547  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000604021  decreased coverage  0.000188692 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1254  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  43.65 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2562  hypothetical protein  42.08 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3059  hypothetical protein  39.63 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000874464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3097  hypothetical protein  39.26 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.152183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2788  hypothetical protein  42.21 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2616  hypothetical protein  42.21 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2682  hypothetical protein  42.21 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2567  hypothetical protein  42.21 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00554266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2658  hypothetical protein  41.39 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.550695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0038  putative outer membrane/exported protein  27.76 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.457943  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0236  hypothetical protein  28.28 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0038  hypothetical protein  27.76 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0039  putative outer membrane/exported protein  27.76 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0037  putative outer membrane/hypothetical protein  27.76 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548328  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4026  hypothetical protein  28.22 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0037  hypothetical protein  32.61 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0014  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1505  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4021  hypothetical protein  24.29 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>