More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0942 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 495 aa  978    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.46 
 
 		 495 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.85 
 
 		 495 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.65 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.65 
 
 		 495 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.53 
 
 		 495 aa  594  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.41 
 
 		 495 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.41 
 
 		 495 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.34 
 
 		 497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  42.47 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 560 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 		 634 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  39.21 
 
 		 634 aa  246  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.17 
 
 		 712 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.89 
 
 		 712 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 		 716 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  44.55 
 
 		 561 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  44.55 
 
 		 561 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  39.94 
 
 		 557 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 634 aa  236  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 		 713 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 554 aa  233  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 		 629 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  39.04 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  39.19 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  41.02 
 
 		 629 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 638 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 		 560 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  38.78 
 
 		 626 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 554 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  39.23 
 
 		 629 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  39.01 
 
 		 632 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 554 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 554 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  38.95 
 
 		 629 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 		 554 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  36.5 
 
 		 630 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 		 555 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  38.74 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  38.94 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.64 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 625 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 554 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 554 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 		 568 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.47 
 
 		 554 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  38.29 
 
 		 629 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 568 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.46 
 
 		 624 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.16 
 
 		 624 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 624 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 		 541 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  39.88 
 
 		 545 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.16 
 
 		 624 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 558 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.75 
 
 		 630 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 		 541 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 630 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 		 674 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  39.26 
 
 		 629 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 633 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 633 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 630 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  37.64 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 		 548 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.32 
 
 		 630 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.24 
 
 		 628 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.84 
 
 		 643 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 543 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 		 630 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 		 630 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 630 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  39.63 
 
 		 629 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.7 
 
 		 630 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  36.05 
 
 		 630 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 628 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  40.18 
 
 		 545 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 548 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 		 638 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 		 638 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 		 638 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>