231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0919 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  71.56 
 
 		 468 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  72.25 
 
 		 468 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  69.78 
 
 		 468 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  100 
 
 		 467 aa  942    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  70.78 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  69.13 
 
 		 481 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  67.18 
 
 		 469 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  71.1 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  69.63 
 
 		 477 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  70.86 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  70.86 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  70.86 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  69.1 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  66.67 
 
 		 481 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  70.17 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  52.93 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  48.75 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  47.58 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  50 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  47.22 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  46.8 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  43.94 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  39.87 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  38.46 
 
 		 495 aa  259  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  37.96 
 
 		 525 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  32.83 
 
 		 472 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  34.33 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  33.72 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  32.89 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.25 
 
 		 580 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  33.49 
 
 		 460 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  29.39 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  26.45 
 
 		 539 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.44 
 
 		 525 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  24.84 
 
 		 526 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.95 
 
 		 497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.15 
 
 		 487 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  24.53 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  30.1 
 
 		 552 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.16 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  26.04 
 
 		 698 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.76 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.88 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.18 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  27.24 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.05 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  28.63 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  30.41 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  25.74 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.4 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.65 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  25.44 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  24.85 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.85 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.5 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  24.85 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  24.85 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  24.85 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  24.85 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.28 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  26.25 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  31.41 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  28.63 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  26.3 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  35.83 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  42.86 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  42.86 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  42.86 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  42.86 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  42.86 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  42.86 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  41.76 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  38.24 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  31.41 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  31.41 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  29.66 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  26.87 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  35.76 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  43.96 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  35.87 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  29.45 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  43.16 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  28.71 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.36 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  39.56 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  26.41 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.29 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  28.02 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  36.36 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  41.3 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  33.05 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  24.46 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.41 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  27.02 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  34.74 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  38.54 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  34.71 
 
 		 757 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>