290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0884 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.32 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.13 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.9 
 
 
127 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.62 
 
 
131 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.1 
 
 
127 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.1 
 
 
127 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.61 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  51.61 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.48 
 
 
127 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.03 
 
 
126 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.34 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.47 
 
 
132 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019749  unclonable  0.0000000106801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.23 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.92 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.48 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 
133 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  50.81 
 
 
126 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.87 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.87 
 
 
127 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.87 
 
 
127 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.06 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.19 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  43.55 
 
 
146 aa  103  6e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.28 
 
 
127 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.26 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.16 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.58 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.8 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  41.8 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.06 
 
 
158 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.98 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.97 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.16 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.2 
 
 
127 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.37 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.74 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.98 
 
 
143 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.48 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.8 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
138 aa  84.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
130 aa  84.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
130 aa  84.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.27 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.45 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
130 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.27 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.28 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.07 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.38 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.34 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>