84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0861 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  91.24 
 
 		 355 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  91.24 
 
 		 355 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  100 
 
 		 358 aa  740    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  89.83 
 
 		 355 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  91.24 
 
 		 355 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  88.24 
 
 		 357 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  88.73 
 
 		 357 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  91.5 
 
 		 355 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  91.24 
 
 		 355 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  91.02 
 
 		 335 aa  621  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  91.02 
 
 		 335 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  91.02 
 
 		 335 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  90.72 
 
 		 335 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  88.36 
 
 		 339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  80.36 
 
 		 340 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  70.09 
 
 		 342 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  31.31 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  35.02 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.29 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  27.44 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.68 
 
 		 618 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.77 
 
 		 618 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  23.27 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 		 1156 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 		 699 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  23.04 
 
 		 645 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  24.46 
 
 		 681 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  21.51 
 
 		 665 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  23.93 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  22.95 
 
 		 701 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.94 
 
 		 694 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  21.11 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  21.67 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.83 
 
 		 643 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 		 729 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.33 
 
 		 753 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  24.74 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  24.59 
 
 		 725 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  22.81 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.06 
 
 		 1020 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  24.5 
 
 		 1180 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  22.4 
 
 		 701 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  21.8 
 
 		 651 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  23.04 
 
 		 607 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 		 469 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.62 
 
 		 703 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  22.56 
 
 		 1037 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  22.38 
 
 		 1119 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.15 
 
 		 764 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  21.91 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  21.29 
 
 		 756 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  22.06 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  23.9 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  22.06 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.58 
 
 		 1805 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  21.66 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.37 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  22.22 
 
 		 645 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  20.21 
 
 		 752 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.33 
 
 		 723 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  20.79 
 
 		 447 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>