85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0746 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  100 
 
 		 297 aa  567  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  61.03 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  55.63 
 
 		 286 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  52.99 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  52.99 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  52.43 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.54 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  47.86 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  45.77 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  54.36 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  50.52 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  45.04 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  43.64 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  45.3 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  47.32 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  45.64 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  42.21 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  43.43 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  42.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.06 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  39.66 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  43.96 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  45.97 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  39.72 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  45.49 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  52.28 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  56.72 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  48.06 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  51.76 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  41.91 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  57.09 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  49 
 
 		 194 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.54 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  49.25 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.38 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  41.79 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  41.94 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  40.64 
 
 		 254 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  41.09 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  47.94 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  27.09 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.57 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  32 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  29.15 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.32 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  35.37 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  33.55 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  33.55 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  33.33 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  31.51 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  32.26 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  26.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  26.91 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  26.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  26.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  26.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  26.91 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  25.74 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  26.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  29.73 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  30.17 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.79 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  26.24 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  30.6 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  28.9 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>