79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0741 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  38.3 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  35.25 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.91 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  30.28 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  30.28 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  30.3 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  29.58 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  28.87 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  29.08 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  30.61 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  30.61 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.53 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.87 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.28 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  29.58 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  30.99 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.28 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  30.99 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  30.99 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  28.68 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  30.28 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  30.28 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  30.28 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  29.58 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  28.19 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  27.66 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  28.57 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  23.08 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  23.97 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000845431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  28.87 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.52 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  25.18 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.18 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  27.21 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  25.18 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  27.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  23.45 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  24.16 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  21.71 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.17 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  21.71 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  21.71 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000028  hemolysin-coregulated protein  25.95 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  22.6 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.17 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  26.06 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  22.07 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  22.7 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  25 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  25 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  24.14 
 
 		 160 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  24.5 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  23.14 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  24.64 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  27.27 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>