More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0724 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0724  Zn-dependent peptidase-like protein  100 
 
 
478 aa  974    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3093  peptidase M16 domain-containing protein  48.43 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0599464  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0879  peptidase M16 domain-containing protein  47.81 
 
 
471 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0630981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0842  peptidase M16 domain-containing protein  46.97 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.060004  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3445  peptidase M16 domain-containing protein  46.03 
 
 
490 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0655  peptidase M16 domain-containing protein  47.48 
 
 
474 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0932  peptidase M16 domain protein  47.65 
 
 
472 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102466  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3429  peptidase M16 domain-containing protein  46.28 
 
 
472 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0941  peptidase M16 domain-containing protein  47.22 
 
 
472 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0907  peptidase M16 domain-containing protein  45.87 
 
 
472 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3824  peptidase M16 domain-containing protein  46.71 
 
 
469 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000529085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0759  peptidase M16 domain-containing protein  45.81 
 
 
483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  30.49 
 
 
429 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  35.66 
 
 
447 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  38.02 
 
 
427 aa  127  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.89 
 
 
429 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  26.2 
 
 
461 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  22.93 
 
 
440 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  26.49 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  25.66 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  25.78 
 
 
928 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 
463 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  25.85 
 
 
476 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  24.94 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  26.69 
 
 
948 aa  113  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  31.98 
 
 
952 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.95 
 
 
942 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.07 
 
 
954 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.61 
 
 
896 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  22.3 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  25.54 
 
 
464 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  23.37 
 
 
431 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1427  peptidase M16 domain protein  28.83 
 
 
953 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.998852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  30.24 
 
 
901 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  31.72 
 
 
436 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1329  peptidase M16 domain protein  28.47 
 
 
951 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.785747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  33.01 
 
 
903 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  30.31 
 
 
904 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  23.47 
 
 
440 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  24.82 
 
 
957 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.9 
 
 
944 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  27.51 
 
 
484 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  31.23 
 
 
413 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 
950 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  26.03 
 
 
428 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.97 
 
 
944 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  27.1 
 
 
950 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  26.79 
 
 
470 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2523  peptidase M16-like  28.47 
 
 
950 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  35.6 
 
 
959 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  32.62 
 
 
459 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  29.86 
 
 
967 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.67 
 
 
950 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  23.71 
 
 
929 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  25.39 
 
 
442 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  27.12 
 
 
949 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  22.57 
 
 
912 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  24.94 
 
 
443 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  28.21 
 
 
414 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  24.4 
 
 
949 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  24.95 
 
 
945 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  25 
 
 
464 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  31.52 
 
 
437 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  29.41 
 
 
434 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  25.66 
 
 
443 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 
428 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  28.17 
 
 
482 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  24.77 
 
 
918 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  24.68 
 
 
919 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 
949 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  27.51 
 
 
945 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  24.21 
 
 
434 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 
949 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 
949 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  33.69 
 
 
424 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  22.93 
 
 
417 aa  101  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.58 
 
 
958 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  30.69 
 
 
439 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  24.17 
 
 
443 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  26.09 
 
 
431 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.14 
 
 
411 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  36.87 
 
 
423 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  26.51 
 
 
428 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  27.56 
 
 
949 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  22.49 
 
 
526 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.49 
 
 
944 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  22.89 
 
 
945 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  25.93 
 
 
509 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  23.64 
 
 
453 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  27.17 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  23.77 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  32.26 
 
 
484 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  24.08 
 
 
508 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.37 
 
 
954 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  32.26 
 
 
484 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  23.57 
 
 
514 aa  99  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  31.38 
 
 
411 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.05 
 
 
530 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  23.85 
 
 
513 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>