More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0708 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  72.57 
 
 		 572 aa  866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  73.48 
 
 		 569 aa  879    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  100 
 
 		 589 aa  1208    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  52.42 
 
 		 638 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  50.97 
 
 		 634 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  51.9 
 
 		 594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  53.05 
 
 		 563 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  54.08 
 
 		 568 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 639 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  62.59 
 
 		 474 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  55.6 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  53.12 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  52.97 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  53.66 
 
 		 463 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  54.8 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  50.69 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  52.3 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  60.72 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  51.94 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  51.97 
 
 		 742 aa  438  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  47.7 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  52.27 
 
 		 459 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  56.51 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  51.55 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  47.7 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  47.7 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  57.66 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  52.79 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.6 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  49.41 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  49.17 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  49.17 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  50.48 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  50 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  49.17 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  49.17 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  56.06 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  49.17 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  51.2 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  50.36 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  56.06 
 
 		 478 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  49.05 
 
 		 460 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  48.64 
 
 		 442 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  49.58 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  53.21 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  48.29 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  50.84 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  54.27 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  51.21 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  49.54 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  53.89 
 
 		 624 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  55.03 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  48.18 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.6 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  52.59 
 
 		 491 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  49.31 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 467 aa  412  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  46.4 
 
 		 454 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  50.8 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  45.79 
 
 		 496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  51.33 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  49.63 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  54.72 
 
 		 485 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  53.5 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  48.22 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  56.39 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  53.06 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  45.74 
 
 		 451 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  43.73 
 
 		 560 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  54.26 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  54.41 
 
 		 608 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  50 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  46.59 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  50.51 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  49.2 
 
 		 484 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  52.08 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  50 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  54.08 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  50.74 
 
 		 455 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  49.14 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  46.07 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  48.6 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  43.91 
 
 		 508 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  50.93 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  50.93 
 
 		 523 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  50.93 
 
 		 521 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  53.06 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  45.81 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  49.07 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  45.17 
 
 		 485 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  49.52 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  58.53 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  50.93 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  48.56 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  50.93 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  50.93 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>