20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0696 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  30.38 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  43.94 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  46.88 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  34.38 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  45.65 
 
 
217 aa  44.7  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  42.31 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  43.14 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  31.46 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  47.37 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  47.06 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  30.56 
 
 
544 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2066  ATP-binding region, ATPase-like  41.86 
 
 
161 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000294793  normal  0.545491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>