More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0616 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
508 aa  1011    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  57.74 
 
 
510 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  57.74 
 
 
510 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  57.74 
 
 
510 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  57.74 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  57.94 
 
 
511 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  57.94 
 
 
511 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  57.94 
 
 
511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  57.54 
 
 
518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  57.76 
 
 
511 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  56.01 
 
 
510 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  53.59 
 
 
515 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  41.9 
 
 
500 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  43.83 
 
 
497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  44.7 
 
 
495 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  42.6 
 
 
500 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 
500 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  46.32 
 
 
500 aa  349  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  42.58 
 
 
497 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
496 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  42.58 
 
 
497 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  40.45 
 
 
496 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
499 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  41.52 
 
 
500 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  41.9 
 
 
500 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 
498 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  47.96 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  43.24 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  42.3 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 
497 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  40.32 
 
 
542 aa  332  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  43.15 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  42.46 
 
 
493 aa  326  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  39.53 
 
 
500 aa  324  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  43.09 
 
 
497 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  41.82 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  40.44 
 
 
506 aa  317  4e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 
514 aa  316  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.04 
 
 
492 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  40.21 
 
 
500 aa  310  4e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  42.53 
 
 
481 aa  310  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.34 
 
 
497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  44.5 
 
 
491 aa  306  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
494 aa  305  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 
500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  40.9 
 
 
488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  42.06 
 
 
500 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  44.11 
 
 
489 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 
489 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  47.99 
 
 
556 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 
511 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  44.14 
 
 
488 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  48.65 
 
 
484 aa  286  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  43.67 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  43.67 
 
 
489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  38.72 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 
490 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.51 
 
 
496 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14931  leucyl aminopeptidase  35.86 
 
 
495 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  34.5 
 
 
493 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  48.11 
 
 
536 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  38.6 
 
 
490 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  43.98 
 
 
536 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  33.64 
 
 
488 aa  279  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  38.65 
 
 
493 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 
503 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  47.8 
 
 
486 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  38.2 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 
503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  47.94 
 
 
503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.97 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2108  leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 
489 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  43.75 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
503 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
503 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
503 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
503 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  37.65 
 
 
503 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  47.94 
 
 
503 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.88 
 
 
488 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  37.53 
 
 
503 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
522 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3910  leucyl aminopeptidase  39.22 
 
 
491 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.723186  normal  0.561505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  39.15 
 
 
501 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
503 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
503 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3861  leucyl aminopeptidase  39 
 
 
491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  38.89 
 
 
493 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  44.23 
 
 
510 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  46.04 
 
 
491 aa  269  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>