53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0582 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  295  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  43.66 
 
 
141 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  35.56 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  36 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  37.3 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  35.59 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  34.17 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  33.04 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  29.23 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.7 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  27.54 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  30.22 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  27.14 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  26.56 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  27.54 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  27.12 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  27.12 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.56 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  26.27 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  27.96 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  27.97 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.87 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  26.61 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  29.17 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  26.21 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  27.73 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  26.23 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  23.97 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  23.15 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  25.93 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  25.38 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  23.88 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  23.02 
 
 
131 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  26.72 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  21.01 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  22.46 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  26.15 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  22.73 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  22.39 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  23.73 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  26.52 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  26.72 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  27.05 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  23.36 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>