31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0556 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0556  hypothetical protein  100 
 
 
1261 aa  2597    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.170539  normal  0.101449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0936  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.23 
 
 
1251 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.35 
 
 
1049 aa  96.3  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1212 aa  89  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.53 
 
 
1212 aa  88.6  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1212 aa  88.6  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  29.38 
 
 
1215 aa  88.6  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1212 aa  88.6  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.47 
 
 
1092 aa  73.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  29.1 
 
 
1220 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.02 
 
 
1191 aa  62  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 
915 aa  59.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 
1323 aa  59.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 
1191 aa  58.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  28.37 
 
 
917 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  28.97 
 
 
917 aa  55.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  28.97 
 
 
917 aa  55.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  28.5 
 
 
917 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  28.97 
 
 
917 aa  55.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.7 
 
 
1383 aa  54.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  28.97 
 
 
917 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  27.53 
 
 
917 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  29.17 
 
 
917 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  29.17 
 
 
917 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.67 
 
 
1234 aa  52.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.28 
 
 
1285 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  37.23 
 
 
1779 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  31.19 
 
 
1221 aa  45.8  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  30.66 
 
 
671 aa  45.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  41.94 
 
 
618 aa  45.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.28 
 
 
1072 aa  45.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>