40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0551 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  33.94 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  35.78 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 285 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  32.66 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  30.32 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  31.7 
 
 		 322 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.35 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  26.36 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  26.36 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  26.36 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  31.76 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  26.24 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  24.44 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.48 
 
 		 2213 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  26.05 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.12 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  22.65 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  21.65 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  22.41 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.81 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>