More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0493 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 114 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  56.88 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  53.51 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  55.88 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  54.39 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  53.51 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 258 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  53.51 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  55.26 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  54.72 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  54.13 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 275 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.69 
 
 		 270 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  55.05 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  52.29 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.82 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  46.85 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.36 
 
 		 305 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  44.12 
 
 		 113 aa  95.9  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.43 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.43 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  59.72 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  45 
 
 		 248 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.58 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.43 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.32 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.95 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  44.74 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  55.56 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.25 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  53.16 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  48.81 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  54.17 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  43.36 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  48.05 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  52.11 
 
 		 309 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  52.11 
 
 		 349 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  45.12 
 
 		 336 aa  76.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>