40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0490 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 
615 aa  1269    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  30.56 
 
 
634 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  31.19 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
623 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
617 aa  180  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  33.11 
 
 
620 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  26.74 
 
 
522 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  27.9 
 
 
503 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  26.57 
 
 
432 aa  88.6  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 
623 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  28.78 
 
 
773 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  26.49 
 
 
708 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  28.19 
 
 
713 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  23.42 
 
 
510 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  24.32 
 
 
621 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
615 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  26.61 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  28.69 
 
 
319 aa  54.3  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61908 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  25.72 
 
 
285 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  38.2 
 
 
420 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  25.08 
 
 
285 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  25.08 
 
 
285 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  27.95 
 
 
316 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
495 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 
281 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  25.26 
 
 
420 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  33.75 
 
 
286 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 
398 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
321 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  31.41 
 
 
281 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  32.5 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  29.25 
 
 
309 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  25.84 
 
 
285 aa  44.7  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 
285 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  26.95 
 
 
291 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1994  peptidase M48 Ste24p  44 
 
 
405 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  27.54 
 
 
294 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  30.22 
 
 
419 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  30.22 
 
 
419 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  28 
 
 
427 aa  43.5  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>