More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0438 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 755 aa  1532    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 760 aa  446  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 469 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  39.3 
 
 		 461 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 376 aa  150  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 461 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.62 
 
 		 431 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 376 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 376 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 376 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 458 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 546 aa  145  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 523 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  36.73 
 
 		 442 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  33.88 
 
 		 464 aa  144  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  37.78 
 
 		 561 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.5 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  35.8 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  37.95 
 
 		 434 aa  142  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  39.56 
 
 		 376 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 376 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 376 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  39.01 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  39.01 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  36.89 
 
 		 561 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  36.56 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 536 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  40 
 
 		 371 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 417 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  36.24 
 
 		 442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 535 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 442 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 442 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  36.24 
 
 		 442 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  33.62 
 
 		 485 aa  138  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  36.24 
 
 		 442 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 442 aa  138  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 456 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 456 aa  138  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 		 782 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 429 aa  137  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  38.74 
 
 		 478 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  25.27 
 
 		 982 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0816  sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 401 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0938  sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2192  sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 433 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1590  sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 433 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0033  sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 433 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0845  sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  36.86 
 
 		 538 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1238 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  38.53 
 
 		 452 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 535 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1313 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.07 
 
 		 957 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  36.32 
 
 		 433 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  36.32 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  36.32 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  37.72 
 
 		 433 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  33.76 
 
 		 437 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  36.32 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  36.32 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  36.32 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  36.32 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  33.63 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  37.28 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  37.28 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  37.28 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  34.86 
 
 		 432 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  36.32 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  35.32 
 
 		 433 aa  129  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3281  sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 483 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00282133  hitchhiker  0.000112665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  37.28 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1060 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 433 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  33.33 
 
 		 437 aa  127  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  33.92 
 
 		 435 aa  125  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  34.96 
 
 		 428 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  35.4 
 
 		 428 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  34.07 
 
 		 431 aa  124  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 430 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  32.6 
 
 		 451 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  35.84 
 
 		 457 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 550 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3066  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 461 aa  121  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  33.04 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  34.31 
 
 		 523 aa  117  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  35.56 
 
 		 458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  35.56 
 
 		 458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  35.56 
 
 		 458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 480 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2316  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 462 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  35.29 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>