More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0285 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  62.39 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  61.8 
 
 		 238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  60.52 
 
 		 238 aa  297  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  62.11 
 
 		 234 aa  297  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  62.16 
 
 		 227 aa  294  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  60.36 
 
 		 226 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  61.26 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  60.81 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  60.36 
 
 		 245 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  60.09 
 
 		 224 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  58.11 
 
 		 224 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  58.11 
 
 		 224 aa  278  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  58.56 
 
 		 224 aa  278  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  58.11 
 
 		 224 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  58.3 
 
 		 230 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  59.46 
 
 		 224 aa  274  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  59.01 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  56.05 
 
 		 224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  60.45 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  55.16 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.31 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  56.31 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  57.66 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  56.31 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  55.86 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  55.86 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  55.86 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  57.21 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  52.91 
 
 		 228 aa  254  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  54.26 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  39.3 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  39.3 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.6 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.6 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.16 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.16 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.72 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.53 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.14 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  30.09 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  32.72 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.8 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  31.74 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  30.8 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  29.61 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.58 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.55 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.24 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  32.72 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.65 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  34.62 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.32 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.94 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  39.66 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  38.84 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.43 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  40.52 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  41.38 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  27.18 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  40.52 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  39.66 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  39.66 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  29.29 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  39.13 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  39.66 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.21 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.35 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  36.29 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  44.44 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  38.1 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>