More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0104 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 365 aa  754    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  62.71 
 
 		 366 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  64.53 
 
 		 361 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  64.53 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  64.53 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  64.8 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.25 
 
 		 361 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  64.8 
 
 		 361 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  64.53 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  60.17 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  44.2 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  43.73 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.37 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  43.92 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  43.09 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  43.45 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  43.37 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  36.95 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  29.57 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.96 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.22 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  42.77 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.22 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  25.47 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.53 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.38 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 370 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.87 
 
 		 415 aa  99.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.82 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.5 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.5 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.5 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  42.75 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.5 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.91 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.91 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.91 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  30.62 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.24 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  27.97 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  31.1 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.93 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  25.24 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  25.24 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  25.24 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>