More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0099 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
211 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  72.99 
 
 
215 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  72.99 
 
 
215 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  72.99 
 
 
215 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.36887e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  73.56 
 
 
215 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  73.93 
 
 
213 aa  328  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  72.04 
 
 
215 aa  326  2e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  73.79 
 
 
220 aa  320  9e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 
215 aa  317  8e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 
215 aa  317  8e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  71.36 
 
 
215 aa  315  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  71.36 
 
 
215 aa  315  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  67.79 
 
 
215 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  63.94 
 
 
217 aa  287  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  66.18 
 
 
218 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  64.93 
 
 
225 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  65.22 
 
 
215 aa  282  2e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  1.33916e-05 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  43.19 
 
 
214 aa  197  1e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
218 aa  188  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  43.75 
 
 
211 aa  181  5e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
211 aa  181  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
242 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  37.98 
 
 
220 aa  146  2e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 
220 aa  145  4e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
221 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
221 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
221 aa  140  2e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
221 aa  139  2e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
227 aa  136  3e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 
215 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
215 aa  133  2e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
223 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
245 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
239 aa  126  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
236 aa  126  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
238 aa  125  4e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 
241 aa  125  4e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  35.98 
 
 
231 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
241 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
236 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
235 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
239 aa  120  1e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
239 aa  120  1e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
239 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
239 aa  120  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
239 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
239 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
208 aa  117  1e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
244 aa  117  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
251 aa  116  2e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
251 aa  116  2e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
252 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
252 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
252 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
252 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
253 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
239 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
220 aa  110  1e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
222 aa  110  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
223 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
204 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
204 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
219 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
217 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
220 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
209 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
237 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
204 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  30.25 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  85.1  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
211 aa  84  1e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  40.2 
 
 
221 aa  80.5  2e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
220 aa  80.1  2e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
220 aa  65.5  6e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
206 aa  58.9  5e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 
199 aa  57.4  1e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 
185 aa  57.4  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
226 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
226 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
226 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 
195 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
212 aa  53.9  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  5.3734e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
194 aa  53.1  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
200 aa  52.8  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
214 aa  52.4  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  9.67235e-06 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
277 aa  52.4  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
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NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 
203 aa  52.4  5e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
195 aa  52  7e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
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NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
205 aa  51.6  8e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
231 aa  51.6  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.89 
 
 
195 aa  51.2  1e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.22834e-06  n/a   
 
 
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