53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0090 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  474  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  59.43 
 
 
212 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  58.02 
 
 
212 aa  251  4e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  58.02 
 
 
212 aa  250  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  56.13 
 
 
212 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  56.6 
 
 
212 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  56.13 
 
 
212 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  56.13 
 
 
212 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  57.08 
 
 
212 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  54.59 
 
 
220 aa  244  5e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  56.6 
 
 
212 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  52.94 
 
 
220 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  52.7 
 
 
222 aa  238  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  51.35 
 
 
232 aa  235  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  50.45 
 
 
222 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  48.18 
 
 
223 aa  197  1e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
216 aa  133  2e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
217 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
212 aa  130  2e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
223 aa  129  4e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  31.9 
 
 
212 aa  128  7e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  31.9 
 
 
213 aa  127  1e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  33.49 
 
 
233 aa  127  2e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  32.7 
 
 
214 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  32.38 
 
 
222 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  30.81 
 
 
212 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  32.21 
 
 
215 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  32.85 
 
 
257 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  32.85 
 
 
225 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
212 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  31.6 
 
 
212 aa  116  2e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
212 aa  116  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
212 aa  116  4e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  28.71 
 
 
215 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  33.65 
 
 
222 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  28.85 
 
 
212 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
211 aa  110  2e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
211 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
214 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  30.84 
 
 
211 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  30.14 
 
 
230 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  29.47 
 
 
223 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  28.04 
 
 
215 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
211 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.04 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
217 aa  80.5  2e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  24.06 
 
 
214 aa  69.3  5e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  25.11 
 
 
214 aa  52  7e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  21.85 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>