48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0089 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0089  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  348  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00261813  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4728  hypothetical protein  59.02 
 
 
183 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4114  hypothetical protein  58.7 
 
 
184 aa  172  2e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3911  hypothetical protein  56.28 
 
 
183 aa  171  7e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0098  hypothetical protein  56.04 
 
 
178 aa  170  8e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0055  hypothetical protein  53.85 
 
 
178 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714058  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3718  hypothetical protein  56.91 
 
 
177 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3909  hypothetical protein  57.61 
 
 
184 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307626  normal  0.259265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4001  hypothetical protein  57.61 
 
 
184 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0092  hypothetical protein  54.7 
 
 
178 aa  168  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0634394  hitchhiker  0.000108665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0049  hypothetical protein  55.68 
 
 
186 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4349  hypothetical protein  55.14 
 
 
186 aa  164  7e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3624  hypothetical protein  56.83 
 
 
182 aa  164  7e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4491  hypothetical protein  55.14 
 
 
186 aa  164  7e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.155863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4294  hypothetical protein  55.14 
 
 
186 aa  164  7e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113547  unclonable  4.44026e-12 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3947  hypothetical protein  57.07 
 
 
182 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4162  protein of unknown function DUF414  48.31 
 
 
177 aa  94.4  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0108386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3965  protein of unknown function DUF414  42 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00236039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4885  hypothetical protein  39.47 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0120647  hitchhiker  4.67082e-06 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0025  hypothetical protein  45.38 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022411  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0023  hypothetical protein  45.38 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00725137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4193  hypothetical protein  45.38 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4100  hypothetical protein  39.86 
 
 
171 aa  82.8  2e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128522  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0209  hypothetical protein  33.16 
 
 
188 aa  82.4  3e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.5056  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4515  hypothetical protein  41.32 
 
 
185 aa  82  4e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2404  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  81.6  5e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4340  hypothetical protein  42.2 
 
 
169 aa  80.1  1e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00410643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4249  hypothetical protein  42.2 
 
 
169 aa  80.5  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.236524  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03700  hypothetical protein  42.2 
 
 
169 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00344237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03751  hypothetical protein  42.2 
 
 
169 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00334107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4384  hypothetical protein  42.2 
 
 
169 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000152242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4121  protein of unknown function DUF414  42.2 
 
 
169 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.911509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4150  hypothetical protein  42.2 
 
 
168 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0626838  normal  0.0164752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4091  hypothetical protein  42.2 
 
 
168 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.74689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5311  hypothetical protein  42.2 
 
 
168 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.58573e-05  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4225  hypothetical protein  44.09 
 
 
184 aa  77.4  9e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0915733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4214  hypothetical protein  43.36 
 
 
171 aa  75.9  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.831944  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4392  hypothetical protein  43.36 
 
 
171 aa  75.9  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4235  hypothetical protein  43.36 
 
 
171 aa  75.9  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000760229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4285  hypothetical protein  43.36 
 
 
171 aa  75.9  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0130421  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4331  hypothetical protein  43.36 
 
 
171 aa  75.9  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0353263  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00579  hypothetical protein  43.64 
 
 
180 aa  73.6  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0012  hypothetical protein  34.09 
 
 
175 aa  72.8  3e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.91121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0231  hypothetical protein  30.94 
 
 
182 aa  68.2  7e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001913  hypothetical protein  36 
 
 
180 aa  64.3  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4825  hypothetical protein  30.21 
 
 
208 aa  59.7  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0470  hypothetical protein  32.85 
 
 
214 aa  52.4  3e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00012  hypothetical protein  32.89 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>