228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0083 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
317 aa  661  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  56.09 
 
 
329 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  56.15 
 
 
327 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  56.81 
 
 
337 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  56.81 
 
 
337 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  56.81 
 
 
337 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  53.48 
 
 
324 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  54.84 
 
 
327 aa  342  6e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  56.11 
 
 
329 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  54.52 
 
 
327 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00396e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  54.52 
 
 
327 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  54.19 
 
 
327 aa  339  3e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  52.73 
 
 
333 aa  339  3e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  55.12 
 
 
330 aa  335  9e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 
329 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 
324 aa  298  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  37.46 
 
 
322 aa  225  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  39.47 
 
 
335 aa  220  2e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 
302 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  41.36 
 
 
338 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  37.23 
 
 
329 aa  218  9e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  39.3 
 
 
345 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  40.71 
 
 
322 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  34.21 
 
 
338 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  34.21 
 
 
338 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  34.21 
 
 
338 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  34.21 
 
 
338 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  34.21 
 
 
338 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  38.25 
 
 
334 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  37.34 
 
 
330 aa  190  3e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  34.58 
 
 
340 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  36.82 
 
 
340 aa  188  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  36.82 
 
 
340 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  35.62 
 
 
638 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  37.03 
 
 
337 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  37.03 
 
 
331 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  35.39 
 
 
331 aa  184  1e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
364 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  34.87 
 
 
345 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  36.1 
 
 
331 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.44 
 
 
345 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  35.99 
 
 
330 aa  173  4e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  31.97 
 
 
318 aa  156  5e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  34.78 
 
 
315 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  33.01 
 
 
344 aa  130  4e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
315 aa  129  5e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
314 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
314 aa  129  8e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  34.12 
 
 
324 aa  129  9e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
315 aa  128  1e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
314 aa  127  2e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
315 aa  126  4e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  5.18617e-06 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
320 aa  125  8e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
314 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
337 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
314 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  33.97 
 
 
333 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  34.04 
 
 
332 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  30.51 
 
 
320 aa  120  4e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  29.93 
 
 
330 aa  120  4e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
303 aa  119  8e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 
323 aa  117  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
333 aa  117  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  32.85 
 
 
363 aa  114  1e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
329 aa  114  2e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
330 aa  113  4e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 
330 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  28.62 
 
 
329 aa  110  2e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
345 aa  110  4e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  29.29 
 
 
331 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  29.29 
 
 
331 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
314 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
333 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  31.25 
 
 
330 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  31.37 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
320 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  27.99 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
288 aa  82.4  9e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
277 aa  81.3  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
326 aa  78.6  1e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
263 aa  75.9  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.35341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.97 
 
 
291 aa  74.3  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
278 aa  72.8  6e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
290 aa  72  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  27.92 
 
 
288 aa  67.4  3e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
289 aa  66.6  5e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
302 aa  66.6  5e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
302 aa  66.2  6e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.47 
 
 
286 aa  66.6  6e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
302 aa  66.2  6e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>