237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0080 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  82.77 
 
 
408 aa  716  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  81.31 
 
 
408 aa  704  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  81.31 
 
 
408 aa  708  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  100 
 
 
412 aa  841  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  82.77 
 
 
408 aa  716  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  81.31 
 
 
408 aa  707  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  79.02 
 
 
410 aa  684  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  82.77 
 
 
408 aa  716  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  80.92 
 
 
414 aa  698  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  81.55 
 
 
408 aa  708  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  81.55 
 
 
408 aa  709  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  81.55 
 
 
408 aa  708  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  78.88 
 
 
408 aa  692  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  81.55 
 
 
410 aa  708  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  79.61 
 
 
408 aa  693  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  80.43 
 
 
414 aa  706  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  60.1 
 
 
418 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  59.07 
 
 
411 aa  464  1e-130  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  59.75 
 
 
411 aa  460  1e-128  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  57.77 
 
 
415 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  59.21 
 
 
408 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  57.46 
 
 
416 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  57.14 
 
 
407 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  60.1 
 
 
414 aa  441  1e-122  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  61.3 
 
 
423 aa  441  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  61.2 
 
 
407 aa  438  1e-122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  57.96 
 
 
403 aa  441  1e-122  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  60.94 
 
 
407 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  60.94 
 
 
407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  56.51 
 
 
431 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  60.94 
 
 
407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  60.94 
 
 
407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  53.33 
 
 
407 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  57 
 
 
399 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  60.94 
 
 
407 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  60.94 
 
 
407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  55.39 
 
 
406 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  55.05 
 
 
406 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  59.79 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  59.33 
 
 
407 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  59.79 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  56.23 
 
 
406 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  58.81 
 
 
407 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  56.23 
 
 
406 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  59.53 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  58.75 
 
 
407 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  53.56 
 
 
402 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.74389e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  60.68 
 
 
407 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  58.03 
 
 
407 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  56.62 
 
 
400 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  55.98 
 
 
406 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  54.37 
 
 
431 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  57.74 
 
 
405 aa  417  1e-115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  56.75 
 
 
401 aa  416  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  52.96 
 
 
420 aa  417  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  52.96 
 
 
407 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  52.71 
 
 
445 aa  411  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0914  imidazolonepropionase  52.71 
 
 
407 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  54.73 
 
 
401 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  54.05 
 
 
425 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  51.62 
 
 
416 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  55.99 
 
 
407 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0882  imidazolonepropionase  52.71 
 
 
407 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  52.46 
 
 
407 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  53.43 
 
 
403 aa  406  1e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  53.43 
 
 
405 aa  405  1e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  53.33 
 
 
416 aa  406  1e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  51.57 
 
 
446 aa  406  1e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  54.21 
 
 
401 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  55.17 
 
 
404 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  55.67 
 
 
404 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  55.06 
 
 
401 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  55.87 
 
 
402 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  53.69 
 
 
401 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  54.55 
 
 
403 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  54.57 
 
 
401 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  56.39 
 
 
405 aa  399  1e-110  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  54.57 
 
 
401 aa  399  1e-110  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  55.61 
 
 
402 aa  401  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  53.57 
 
 
403 aa  400  1e-110  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  53.32 
 
 
403 aa  401  1e-110  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  54.57 
 
 
401 aa  398  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  54.73 
 
 
416 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  52.97 
 
 
405 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  55.39 
 
 
400 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  55.53 
 
 
400 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  54.16 
 
 
406 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  54.26 
 
 
401 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  50.98 
 
 
418 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  54.29 
 
 
403 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  53.96 
 
 
407 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  50.37 
 
 
402 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03129  imidazolonepropionase  49.4 
 
 
419 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  52.97 
 
 
405 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  50.37 
 
 
417 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  52.25 
 
 
407 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  50.99 
 
 
420 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  48.22 
 
 
456 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  53.52 
 
 
410 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  49.25 
 
 
402 aa  359  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>