More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0078 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
665 aa  1379  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 
688 aa  290  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  28.98 
 
 
645 aa  244  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.22 
 
 
645 aa  240  6e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.1 
 
 
755 aa  236  1e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.84 
 
 
645 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 
645 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.69 
 
 
645 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 
645 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  31.08 
 
 
640 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 
634 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
662 aa  225  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 
644 aa  223  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  30.49 
 
 
655 aa  216  1e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
657 aa  214  3e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  5.39912e-08 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.02 
 
 
685 aa  202  1e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.22 
 
 
662 aa  199  2e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.52 
 
 
654 aa  199  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  1.77281e-10 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.98 
 
 
656 aa  199  2e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.22 
 
 
662 aa  199  2e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.87 
 
 
642 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.22 
 
 
662 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16056e-10 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.77 
 
 
632 aa  197  5e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.29 
 
 
662 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  30.15 
 
 
649 aa  193  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.85 
 
 
649 aa  193  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  27.59 
 
 
636 aa  190  6e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.54 
 
 
654 aa  190  6e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.75 
 
 
662 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.9 
 
 
654 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.72 
 
 
706 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.76 
 
 
626 aa  186  2e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.68 
 
 
661 aa  186  2e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
661 aa  186  2e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.27 
 
 
626 aa  185  2e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.57 
 
 
665 aa  185  2e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.23 
 
 
644 aa  185  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  25.22 
 
 
642 aa  184  4e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.27 
 
 
626 aa  184  5e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 
632 aa  183  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.39 
 
 
705 aa  183  8e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  24.42 
 
 
662 aa  183  9e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 
641 aa  181  3e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.08 
 
 
907 aa  181  3e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.27 
 
 
623 aa  180  6e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.2 
 
 
646 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.13 
 
 
636 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.97 
 
 
665 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
646 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 
650 aa  176  1e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.37 
 
 
653 aa  176  1e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.5 
 
 
924 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.12 
 
 
686 aa  173  8e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.95 
 
 
655 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.11 
 
 
659 aa  173  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.09 
 
 
688 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  33.45 
 
 
759 aa  172  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.66 
 
 
666 aa  171  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.15 
 
 
626 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.89 
 
 
629 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.73 
 
 
626 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  24.57 
 
 
653 aa  167  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.03 
 
 
631 aa  166  1e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.8 
 
 
656 aa  165  2e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.04 
 
 
652 aa  166  2e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.33 
 
 
630 aa  165  2e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.4 
 
 
629 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.93 
 
 
682 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  24.63 
 
 
648 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.88 
 
 
686 aa  161  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  29.36 
 
 
634 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  25.86 
 
 
694 aa  160  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.48 
 
 
642 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  23.49 
 
 
653 aa  154  3e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.56 
 
 
665 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.18 
 
 
632 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.7 
 
 
692 aa  150  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.41 
 
 
731 aa  149  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.24 
 
 
617 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.46 
 
 
650 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  31.53 
 
 
681 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.07 
 
 
597 aa  142  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.76973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.95 
 
 
638 aa  131  5e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.3 
 
 
677 aa  130  7e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.74 
 
 
615 aa  130  1e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.25 
 
 
633 aa  130  1e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.41 
 
 
633 aa  128  4e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 
600 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.8 
 
 
634 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.71 
 
 
572 aa  123  1e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.65 
 
 
668 aa  122  2e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 
588 aa  122  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.08 
 
 
588 aa  122  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.95 
 
 
628 aa  121  4e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.28 
 
 
619 aa  120  8e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.96 
 
 
655 aa  120  8e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  27.36 
 
 
713 aa  120  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.92 
 
 
594 aa  119  1e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.42 
 
 
656 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.33 
 
 
674 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>