44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0075 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0075  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  813  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3965  hypothetical protein  52.77 
 
 
401 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  47.69 
 
 
412 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  48.84 
 
 
383 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  48.72 
 
 
394 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4179  hypothetical protein  48.89 
 
 
403 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4845  hypothetical protein  48.73 
 
 
395 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0079  hypothetical protein  38.75 
 
 
158 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  30.33 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  23.2 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  22.94 
 
 
399 aa  84.7  3e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
378 aa  80.5  5e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  23.89 
 
 
421 aa  79.7  9e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  27.36 
 
 
404 aa  75.5  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  5.38936e-06  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  25.47 
 
 
400 aa  70.9  4e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  28.74 
 
 
442 aa  68.9  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  25.23 
 
 
351 aa  64.3  3e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  28.74 
 
 
462 aa  62.4  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  28.65 
 
 
460 aa  61.2  3e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  30.99 
 
 
405 aa  55.1  2e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  25.2 
 
 
381 aa  53.5  7e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  22.04 
 
 
388 aa  52.8  1e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  22.05 
 
 
384 aa  51.6  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  25.53 
 
 
412 aa  51.6  3e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  21.9 
 
 
384 aa  51.6  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  22.7 
 
 
386 aa  49.7  9e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  23.69 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  21.62 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  27.32 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  45.9 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  25 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  30.86 
 
 
280 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  21.52 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  21.18 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  26.9 
 
 
284 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1243  conserved hypothetical protein, secreted  21.43 
 
 
414 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  26.9 
 
 
284 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  27.36 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.44 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07918e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  26.9 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3965  hypothetical protein  34.88 
 
 
304 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.956387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  34.92 
 
 
276 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29340  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5552  putative esterase  29.91 
 
 
297 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.927665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>