62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0071 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  60.26 
 
 
108 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  61.04 
 
 
88 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  59.74 
 
 
88 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  61.04 
 
 
87 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  61.04 
 
 
87 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  59.74 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  61.84 
 
 
87 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  61.84 
 
 
87 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  57.5 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  58.75 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  53.16 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  53.95 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  48.68 
 
 
85 aa  77.4  6e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  46.75 
 
 
99 aa  68.9  2e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  35.44 
 
 
90 aa  59.3  1e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  37.84 
 
 
100 aa  58.9  2e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  37.18 
 
 
95 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  1.80646e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  35.9 
 
 
117 aa  57  8e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  4.10313e-05  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  34.62 
 
 
94 aa  56.2  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  3.05824e-05  hitchhiker  1.31346e-13 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  55.1  4e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  6.70372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  35.9 
 
 
93 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  7.05286e-09  hitchhiker  4.88804e-15 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  35.9 
 
 
93 aa  54.7  5e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  1.55918e-05  hitchhiker  4.06701e-13 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  35.9 
 
 
93 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.0181e-09  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  34.62 
 
 
94 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  37.33 
 
 
143 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  5.26442e-05  hitchhiker  3.74352e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  38.36 
 
 
96 aa  53.5  8e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  34.62 
 
 
161 aa  53.5  8e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  28.95 
 
 
93 aa  53.5  1e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  34.62 
 
 
115 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.7579e-10  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  36.99 
 
 
96 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  42.19 
 
 
96 aa  50.1  1e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  38.67 
 
 
90 aa  49.3  2e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  36.99 
 
 
96 aa  48.5  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  33.77 
 
 
96 aa  48.1  4e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  39.29 
 
 
93 aa  47.8  6e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  35.06 
 
 
101 aa  47.4  7e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  33.78 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  35.44 
 
 
110 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  43.33 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  30.38 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  31.65 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.98856e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  26.92 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0164  hypothetical protein  39.29 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  23.68 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  32.47 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  36.62 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  32.31 
 
 
97 aa  42  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  32.31 
 
 
97 aa  42  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  46.81 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  29.11 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  28.75 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  30.38 
 
 
90 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  26.25 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  30.77 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  37.04 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  29.11 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  42.55 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  42.55 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>