75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0070 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0070  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  397  1e-110  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4629  hypothetical protein  43.81 
 
 
181 aa  79.3  4e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.355004  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2575  hypothetical protein  35.59 
 
 
204 aa  72  5e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00880643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1388  hypothetical protein  33.6 
 
 
253 aa  70.1  2e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0920868  hitchhiker  0.00023617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1335  hypothetical protein  34.43 
 
 
216 aa  68.9  5e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3164  hypothetical protein  31.2 
 
 
255 aa  68.2  7e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1400  hypothetical protein  32.79 
 
 
217 aa  67.4  1e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1294  hypothetical protein  33.59 
 
 
194 aa  66.2  3e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.070134  normal  0.0207913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1080  hypothetical protein  35.48 
 
 
194 aa  66.2  3e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.62386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1036  hypothetical protein  29.61 
 
 
197 aa  62  5e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.257872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2522  hypothetical protein  39 
 
 
200 aa  62  5e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0835202  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1489  protein of unknown function DUF886  33.11 
 
 
235 aa  61.2  8e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.409079  normal  0.364485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0151  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  60.8  1e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0365  hypothetical protein  35.9 
 
 
198 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2794  protein of unknown function DUF886  37.37 
 
 
193 aa  59.7  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2887  hypothetical protein  27.16 
 
 
227 aa  60.1  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2080  hypothetical protein  35.24 
 
 
187 aa  59.3  4e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1811  hypothetical protein  37.72 
 
 
205 aa  58.5  6e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120207  normal  0.474402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2387  protein of unknown function DUF886  38.14 
 
 
192 aa  58.5  6e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3016  hypothetical protein  31.08 
 
 
237 aa  57.4  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2588  hypothetical protein  27.53 
 
 
197 aa  56.6  2e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3489  protein of unknown function DUF886  35.05 
 
 
191 aa  56.6  2e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6926  protein of unknown function DUF886  33.66 
 
 
191 aa  57  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0684944  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2853  hypothetical protein  30.28 
 
 
191 aa  56.6  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642703  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5173  hypothetical protein  34.82 
 
 
206 aa  57  2e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5908  hypothetical protein  36.44 
 
 
207 aa  56.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2169  hypothetical protein  36.44 
 
 
207 aa  56.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3760  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  56.2  3e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0430  hypothetical protein  33.06 
 
 
190 aa  56.2  3e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.359855  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1533  protein of unknown function DUF886  30.77 
 
 
208 aa  55.8  4e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2714  hypothetical protein  32.69 
 
 
197 aa  55.8  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5084  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  55.8  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0875  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  55.5  5e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0933  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  55.5  5e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1823  hypothetical protein  34.68 
 
 
222 aa  55.1  6e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2944  hypothetical protein  29.05 
 
 
212 aa  55.1  7e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2870  hypothetical protein  29.21 
 
 
235 aa  55.1  7e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.290412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1431  hypothetical protein  28.99 
 
 
195 aa  54.7  8e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2186  hypothetical protein  34.75 
 
 
207 aa  54.3  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0359  hypothetical protein  31.39 
 
 
189 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0325  hypothetical protein  34 
 
 
187 aa  53.9  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5034  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4908  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1255  protein of unknown function DUF886  30.25 
 
 
182 aa  53.5  2e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5955  hypothetical protein  26.94 
 
 
190 aa  53.5  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5837  hypothetical protein  29.81 
 
 
196 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2962  hypothetical protein  28.85 
 
 
202 aa  53.1  3e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  0.713874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67410  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  52.4  4e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5479  hypothetical protein  33.9 
 
 
191 aa  52.4  4e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4156  hypothetical protein  33.05 
 
 
186 aa  52.4  5e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.737957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1702  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  51.6  8e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5931  protein of unknown function DUF886  33.65 
 
 
191 aa  51.2  9e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.810198  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4074  hypothetical protein  34.17 
 
 
197 aa  51.2  9e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2982  hypothetical protein  30.51 
 
 
191 aa  51.2  1e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0163  protein of unknown function DUF886  28.78 
 
 
189 aa  50.1  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0248  hypothetical protein  32.26 
 
 
198 aa  50.4  2e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01699  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01711  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1900  protein of unknown function DUF886  30 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1824  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1985  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  48.9  4e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.280808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2085  hypothetical protein  34.62 
 
 
212 aa  48.9  4e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3904  hypothetical protein  29.27 
 
 
204 aa  48.5  6e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1890  hypothetical protein  30.43 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0233049 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.71 
 
 
446 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1962  hypothetical protein  28.31 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2459  hypothetical protein  28.31 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.984469  normal  0.742679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1450  hypothetical protein  28.75 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.499518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2208  hypothetical protein  34.4 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0982  protein of unknown function DUF886  27.42 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.429638  normal  0.105211 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2110  putative cold inducible protein Ves  29.91 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.560471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2219  hypothetical protein  29.91 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1101  hypothetical protein  31.62 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0858704  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2653  protein of unknown function DUF886  29.55 
 
 
181 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0159203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2509  hypothetical protein  29.06 
 
 
190 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>