More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0064 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  816  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  68.7 
 
 
393 aa  558  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  66.75 
 
 
394 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  66.75 
 
 
394 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.35975e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  66.5 
 
 
394 aa  540  1e-152  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  66.24 
 
 
394 aa  540  1e-152  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  66.75 
 
 
394 aa  539  1e-152  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.53695e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  66.5 
 
 
394 aa  540  1e-152  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  66.5 
 
 
394 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  65.48 
 
 
394 aa  534  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  66.5 
 
 
394 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  3.78391e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  65.83 
 
 
398 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  65.82 
 
 
396 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  64.72 
 
 
394 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  63.71 
 
 
394 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  66.41 
 
 
394 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  60.26 
 
 
394 aa  501  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  61.08 
 
 
413 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  60.61 
 
 
398 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  59.8 
 
 
401 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  61.4 
 
 
398 aa  492  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  61.4 
 
 
398 aa  492  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  59.09 
 
 
460 aa  492  1e-138  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  61.4 
 
 
398 aa  492  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  60 
 
 
397 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  60.36 
 
 
398 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  60.1 
 
 
393 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  61.07 
 
 
394 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  59.54 
 
 
398 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  59.54 
 
 
398 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  58.84 
 
 
460 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  58.48 
 
 
397 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  61.27 
 
 
400 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  58.78 
 
 
393 aa  481  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.27 
 
 
400 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.27 
 
 
400 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.27 
 
 
400 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.01 
 
 
400 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.01 
 
 
400 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  61.27 
 
 
400 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  61.27 
 
 
400 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  61.27 
 
 
400 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  58.88 
 
 
399 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  58.63 
 
 
399 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  60.16 
 
 
397 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  58.27 
 
 
397 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  56.78 
 
 
411 aa  452  1e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  56.04 
 
 
394 aa  453  1e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  54.92 
 
 
393 aa  451  1e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  55.22 
 
 
393 aa  445  1e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  55.13 
 
 
392 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  54.71 
 
 
393 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  58.35 
 
 
396 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  55.92 
 
 
401 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  54.9 
 
 
392 aa  439  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  54.64 
 
 
392 aa  439  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  55.27 
 
 
396 aa  441  1e-122  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  56.78 
 
 
394 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  55.81 
 
 
397 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  55.75 
 
 
392 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  53.09 
 
 
405 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  56.5 
 
 
393 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  54.36 
 
 
392 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  55.97 
 
 
393 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  53.11 
 
 
396 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  1.56467e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  56.23 
 
 
393 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  53.81 
 
 
394 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  54.91 
 
 
400 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  55.44 
 
 
410 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  51.13 
 
 
428 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  55.05 
 
 
395 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  53.99 
 
 
392 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  54.26 
 
 
392 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  52.93 
 
 
392 aa  417  1e-115  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  53.67 
 
 
393 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  53.71 
 
 
399 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  55 
 
 
406 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  53.45 
 
 
394 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  50 
 
 
394 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  52.31 
 
 
392 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  53.42 
 
 
393 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  53.38 
 
 
396 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  52.31 
 
 
393 aa  405  1e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  54.02 
 
 
406 aa  406  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  50.5 
 
 
405 aa  405  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  52.05 
 
 
392 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  51.54 
 
 
392 aa  400  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  52.94 
 
 
402 aa  399  1e-110  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  51.02 
 
 
392 aa  401  1e-110  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  48.71 
 
 
433 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  53.33 
 
 
391 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  53.87 
 
 
394 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  50.76 
 
 
414 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  51.35 
 
 
398 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  46.76 
 
 
438 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  49.75 
 
 
406 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  50.97 
 
 
414 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  48.06 
 
 
419 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  50 
 
 
393 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  51.47 
 
 
392 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>