130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0057 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  100 
 
 
250 aa  513  1e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  64.68 
 
 
251 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52753e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  64.26 
 
 
251 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  64.26 
 
 
251 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  63.4 
 
 
251 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  61.29 
 
 
251 aa  320  1e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  61.79 
 
 
251 aa  320  1e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  61.29 
 
 
251 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02958e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  62.98 
 
 
251 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  59.84 
 
 
253 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  4.26246e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  64.16 
 
 
247 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  60.92 
 
 
251 aa  306  2e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  61.11 
 
 
251 aa  303  2e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  63.3 
 
 
238 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  64.98 
 
 
245 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  54.34 
 
 
251 aa  261  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  43.72 
 
 
259 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  42.04 
 
 
320 aa  183  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  41.63 
 
 
320 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  41.63 
 
 
320 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  41.63 
 
 
320 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 
320 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  41.74 
 
 
314 aa  173  2e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.01 
 
 
319 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  38.49 
 
 
336 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.49 
 
 
336 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  40.55 
 
 
319 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.36 
 
 
313 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.6 
 
 
272 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  40.55 
 
 
319 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.63 
 
 
309 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.64 
 
 
255 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  38.86 
 
 
315 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.17 
 
 
319 aa  164  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.67 
 
 
279 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.1 
 
 
318 aa  162  5e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.6 
 
 
392 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  36.41 
 
 
258 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  36.41 
 
 
257 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.66 
 
 
272 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.5 
 
 
264 aa  155  5e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  37.85 
 
 
382 aa  147  2e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  38.01 
 
 
320 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.90484e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  35.48 
 
 
270 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  141  1e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  32.38 
 
 
260 aa  140  1e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  39.81 
 
 
290 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  33.88 
 
 
255 aa  139  4e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.88 
 
 
255 aa  139  4e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.46 
 
 
317 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.88 
 
 
259 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  39.37 
 
 
482 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.44 
 
 
316 aa  134  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  35.78 
 
 
395 aa  132  4e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  39.78 
 
 
253 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.18 
 
 
430 aa  130  1e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.26 
 
 
259 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.79 
 
 
315 aa  129  4e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.02345e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  30.49 
 
 
258 aa  127  1e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.78 
 
 
293 aa  127  2e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.44 
 
 
543 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.65 
 
 
256 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.63 
 
 
271 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.41 
 
 
313 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.82 
 
 
334 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.64 
 
 
350 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  29.39 
 
 
256 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  28.82 
 
 
256 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
476 aa  121  1e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  29.36 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  29.36 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.16 
 
 
342 aa  120  2e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.97515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  29.36 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  29.36 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.19 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  29.36 
 
 
256 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
259 aa  120  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.5 
 
 
403 aa  118  8e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.56 
 
 
461 aa  117  1e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.33 
 
 
433 aa  110  2e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  34.03 
 
 
432 aa  110  2e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  33.8 
 
 
488 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  34.22 
 
 
390 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1126  putative periplasmic protein  31.25 
 
 
387 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2471  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.28 
 
 
302 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0798  divergent polysaccharide deacetylase superfamily protein  31.35 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0793  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.14 
 
 
391 aa  95.1  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.13 
 
 
490 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0947  conserved hypothetical protein, polysaccharide deacetylase domain protein  34 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0870  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.77 
 
 
381 aa  88.2  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1659  hypothetical protein  31.75 
 
 
364 aa  86.3  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0661  hypothetical protein  30 
 
 
360 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.566707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.95 
 
 
325 aa  84.7  1e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>