More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0054 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  3.73213e-06  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  80.79 
 
 
185 aa  301  5e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.8127e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  78.09 
 
 
185 aa  299  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  80.34 
 
 
182 aa  298  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  79.78 
 
 
182 aa  298  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.2443e-07  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  78.53 
 
 
184 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.62772e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  79.78 
 
 
182 aa  297  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.33363e-05  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  79.78 
 
 
182 aa  296  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.41842e-07  hitchhiker  1.0839e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  79.21 
 
 
182 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.54133e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  79.21 
 
 
182 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.08164e-06  unclonable  4.48586e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  79.21 
 
 
182 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.98121e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  79.21 
 
 
182 aa  294  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  6.02369e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  78.65 
 
 
182 aa  293  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.11727e-08  unclonable  9.97439e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  79.33 
 
 
180 aa  285  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  74.03 
 
 
184 aa  283  1e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.06421e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  75.57 
 
 
181 aa  278  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  5.44891e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  67.42 
 
 
184 aa  261  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.49932e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  69.14 
 
 
177 aa  258  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  66.29 
 
 
182 aa  251  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.48613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  64.04 
 
 
180 aa  251  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  66.29 
 
 
183 aa  251  5e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  64.97 
 
 
179 aa  250  8e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  64.25 
 
 
180 aa  243  1e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.87962e-09  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  59.44 
 
 
181 aa  242  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  3.67586e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  65.73 
 
 
179 aa  240  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  62.36 
 
 
178 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  62.57 
 
 
180 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  62.86 
 
 
180 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  58.86 
 
 
181 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  58.29 
 
 
181 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  60 
 
 
182 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  62.5 
 
 
192 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  61.58 
 
 
182 aa  235  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  57.3 
 
 
179 aa  234  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  60.67 
 
 
185 aa  233  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  60.57 
 
 
180 aa  233  2e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  61.02 
 
 
182 aa  233  2e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  60.34 
 
 
184 aa  231  4e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  3.68449e-06  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  62.01 
 
 
180 aa  231  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.87366e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  62.01 
 
 
180 aa  231  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.2748e-08  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  62.01 
 
 
180 aa  231  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.17644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  60.57 
 
 
181 aa  229  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  58.99 
 
 
293 aa  229  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.74593e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  59.54 
 
 
179 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  58.99 
 
 
256 aa  228  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.98302e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  58.99 
 
 
256 aa  228  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  58.99 
 
 
184 aa  228  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.21267e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  58.99 
 
 
178 aa  228  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  3.1956e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  58.99 
 
 
184 aa  228  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.54067e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  58.99 
 
 
184 aa  228  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.08739e-09  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  59.43 
 
 
179 aa  227  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  57.71 
 
 
182 aa  227  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  57.71 
 
 
182 aa  227  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  58.43 
 
 
184 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.28421e-08  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  57.14 
 
 
182 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  58.43 
 
 
184 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.50407e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  58.43 
 
 
184 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.2792e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  57.71 
 
 
180 aa  215  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  55.62 
 
 
180 aa  207  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  52.27 
 
 
177 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  55.56 
 
 
176 aa  199  1e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  51.7 
 
 
178 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  50 
 
 
185 aa  196  2e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  53.49 
 
 
176 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  48.86 
 
 
179 aa  191  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  52.33 
 
 
181 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
179 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  52.3 
 
 
175 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  52.3 
 
 
175 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  51.72 
 
 
175 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  51.72 
 
 
174 aa  183  1e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  45.76 
 
 
183 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  180  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  4.53095e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  50.87 
 
 
189 aa  180  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  48.54 
 
 
176 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  50 
 
 
179 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  45.51 
 
 
187 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  46.37 
 
 
182 aa  173  1e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  48.85 
 
 
177 aa  173  1e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67215e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  49.42 
 
 
187 aa  173  1e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  45.81 
 
 
182 aa  173  1e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  45.51 
 
 
187 aa  173  1e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  45.81 
 
 
182 aa  172  3e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  46.55 
 
 
177 aa  168  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  46.55 
 
 
177 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  47.7 
 
 
186 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  47.16 
 
 
177 aa  164  6e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.71733e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  47.09 
 
 
175 aa  159  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  45.09 
 
 
189 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  54.04 
 
 
175 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  44.25 
 
 
171 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  45.34 
 
 
187 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  44.71 
 
 
175 aa  153  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  45.83 
 
 
170 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.49084e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  43.71 
 
 
185 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.78452e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  44.05 
 
 
171 aa  145  2e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 
173 aa  145  4e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  44.2 
 
 
177 aa  145  4e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  44.58 
 
 
174 aa  144  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  42.44 
 
 
174 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>