19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0053 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0053  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  170  6e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00250701  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  68.9  2e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.59242e-06  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  68.9  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.53863e-05  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  42.22 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  67.4  6e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.93062e-05  hitchhiker  1.02958e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  65.5  3e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.15973e-08  unclonable  8.7148e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  65.1  3e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  65.5  3e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  41.11 
 
 
91 aa  65.1  4e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  3.50952e-12 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  39.53 
 
 
90 aa  63.9  6e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  38.46 
 
 
92 aa  64.3  6e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  37.78 
 
 
91 aa  62.4  2e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.98861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0035  hypothetical protein  39.53 
 
 
85 aa  62.4  2e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000637046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0035  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  61.2  4e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.21106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  35.96 
 
 
92 aa  56.2  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  37.21 
 
 
91 aa  55.5  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.44431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00381  hypothetical protein  41.86 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002068  hypothetical protein  42.35 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000363608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>