251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0039 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  73.54 
 
 
480 aa  712  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  79.38 
 
 
480 aa  766  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 
480 aa  961  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  79.17 
 
 
480 aa  755  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  79.38 
 
 
480 aa  764  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  77.71 
 
 
480 aa  753  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  79.58 
 
 
480 aa  766  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  78.12 
 
 
480 aa  754  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  78.12 
 
 
480 aa  754  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  78.12 
 
 
480 aa  754  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  78.33 
 
 
480 aa  739  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  78.96 
 
 
480 aa  715  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  79.38 
 
 
480 aa  757  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  78.12 
 
 
480 aa  754  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  78.54 
 
 
480 aa  758  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  59.58 
 
 
481 aa  575  1e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  60 
 
 
481 aa  576  1e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  59.67 
 
 
481 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  56.9 
 
 
481 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  54.53 
 
 
483 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  54.58 
 
 
483 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 
484 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  54.7 
 
 
484 aa  470  1e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  54.79 
 
 
484 aa  468  1e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 
484 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  53.65 
 
 
484 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  51.14 
 
 
484 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  52.12 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  52.34 
 
 
484 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  52.12 
 
 
484 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  51.14 
 
 
484 aa  454  1e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  49.46 
 
 
484 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  49.46 
 
 
484 aa  446  1e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  52.34 
 
 
484 aa  448  1e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  51.69 
 
 
484 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  49.79 
 
 
490 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  47.22 
 
 
472 aa  406  1e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  47.61 
 
 
481 aa  400  1e-110  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  41.41 
 
 
482 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  49.34 
 
 
493 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  40.33 
 
 
482 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  42.83 
 
 
485 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.37 
 
 
482 aa  362  5e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  44.4 
 
 
498 aa  359  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  43.86 
 
 
498 aa  346  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.52 
 
 
466 aa  342  6e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  41.1 
 
 
500 aa  339  6e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  40.71 
 
 
466 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  39.05 
 
 
481 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.65 
 
 
466 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  37.6 
 
 
482 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  39.46 
 
 
510 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  40.49 
 
 
494 aa  316  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.43 
 
 
488 aa  310  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.59 
 
 
478 aa  309  6e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  37.63 
 
 
484 aa  308  2e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  37.94 
 
 
485 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.44 
 
 
482 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.44 
 
 
482 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.8 
 
 
484 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.65 
 
 
483 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  37.06 
 
 
484 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.97 
 
 
482 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  35.61 
 
 
484 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.13 
 
 
481 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.89 
 
 
485 aa  286  6e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  35.61 
 
 
484 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  34.64 
 
 
479 aa  286  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.43 
 
 
482 aa  283  3e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  34.13 
 
 
479 aa  284  3e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  35.79 
 
 
485 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.53 
 
 
488 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.94 
 
 
483 aa  279  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.62 
 
 
491 aa  279  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.74 
 
 
481 aa  279  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  37.91 
 
 
484 aa  279  9e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.99 
 
 
483 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  37.84 
 
 
484 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.85 
 
 
466 aa  276  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  34.21 
 
 
498 aa  275  1e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.91 
 
 
483 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.31 
 
 
483 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.27 
 
 
491 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  37.01 
 
 
477 aa  270  3e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.99 
 
 
498 aa  269  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  36.77 
 
 
485 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  37.7 
 
 
485 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.65 
 
 
483 aa  267  3e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  37.01 
 
 
483 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.65 
 
 
485 aa  266  6e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.35 
 
 
485 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.85 
 
 
483 aa  266  9e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  35.02 
 
 
486 aa  264  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  38.78 
 
 
483 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  35.57 
 
 
478 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  32.45 
 
 
487 aa  264  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  38.57 
 
 
483 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.51 
 
 
480 aa  263  5e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  36.65 
 
 
495 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.73 
 
 
485 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>