280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0035 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  90.5 
 
 
485 aa  853  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  89.28 
 
 
485 aa  849  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  88.66 
 
 
486 aa  831  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  70.72 
 
 
485 aa  652  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  70.31 
 
 
485 aa  643  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  88.87 
 
 
485 aa  843  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  71.55 
 
 
485 aa  647  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  65.77 
 
 
483 aa  677  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  87.22 
 
 
485 aa  852  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  66.94 
 
 
483 aa  637  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  87.22 
 
 
485 aa  835  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  69.48 
 
 
483 aa  668  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  87.01 
 
 
485 aa  852  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  88.87 
 
 
485 aa  843  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  90.7 
 
 
485 aa  853  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  83.3 
 
 
485 aa  824  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  83.71 
 
 
485 aa  830  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  70.31 
 
 
485 aa  643  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  90.5 
 
 
485 aa  853  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
485 aa  974  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  88.87 
 
 
485 aa  843  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  66.53 
 
 
483 aa  642  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  88.87 
 
 
485 aa  843  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  85.57 
 
 
485 aa  829  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  63.47 
 
 
488 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  64.95 
 
 
483 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  66.12 
 
 
483 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  66.12 
 
 
483 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  65.7 
 
 
483 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  66.12 
 
 
483 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.96268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  66.12 
 
 
483 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  65.7 
 
 
483 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  66.12 
 
 
483 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  65.29 
 
 
483 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  67.36 
 
 
483 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.58223e-06  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  65.08 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.58715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  621  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.16067e-05  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  3.37879e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  621  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.19761e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  65.08 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  65.08 
 
 
483 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.1848e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  66.74 
 
 
483 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8042e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  66.94 
 
 
483 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.78342e-06  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  66.94 
 
 
483 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.59691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  58.47 
 
 
482 aa  588  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  58.88 
 
 
483 aa  572  1e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  58.68 
 
 
483 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  56.47 
 
 
483 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  56.61 
 
 
483 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  56.61 
 
 
482 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  57.23 
 
 
482 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  55.97 
 
 
484 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  52.57 
 
 
481 aa  507  1e-142  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  50 
 
 
483 aa  469  1e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  49.08 
 
 
487 aa  470  1e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  48.09 
 
 
488 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  42.8 
 
 
486 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  43 
 
 
486 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  46.15 
 
 
491 aa  417  1e-115  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  45.23 
 
 
485 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  44.97 
 
 
485 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  42.95 
 
 
485 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  43.19 
 
 
474 aa  407  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  43.39 
 
 
488 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  43.42 
 
 
485 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  44.67 
 
 
481 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  43.96 
 
 
484 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  40.7 
 
 
498 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  40.91 
 
 
488 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  40.7 
 
 
488 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  44.04 
 
 
485 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  44.35 
 
 
481 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.25 
 
 
479 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.68 
 
 
482 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  40.69 
 
 
482 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  42.09 
 
 
483 aa  344  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  41.75 
 
 
482 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.89 
 
 
479 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.24 
 
 
478 aa  338  2e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.53 
 
 
494 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.26 
 
 
466 aa  329  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.57 
 
 
476 aa  327  2e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.71 
 
 
491 aa  322  1e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.74 
 
 
477 aa  321  2e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  39.72 
 
 
498 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  37.32 
 
 
485 aa  312  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  38.59 
 
 
484 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  38.78 
 
 
483 aa  310  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  38.68 
 
 
484 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  36.96 
 
 
481 aa  306  4e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  38.46 
 
 
484 aa  304  2e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  36.55 
 
 
481 aa  302  8e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  37.82 
 
 
484 aa  302  8e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.21 
 
 
480 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  38.46 
 
 
484 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  38.45 
 
 
485 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  37.82 
 
 
484 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>