More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0031 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.86 
 
 		 387 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.96 
 
 		 387 aa  728    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.18 
 
 		 387 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.6 
 
 		 387 aa  712    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.18 
 
 		 387 aa  722    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.7 
 
 		 387 aa  727    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.53 
 
 		 387 aa  634    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.47 
 
 		 387 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.73 
 
 		 387 aa  736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.44 
 
 		 387 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.18 
 
 		 387 aa  722    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.99 
 
 		 387 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 387 aa  787    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  89.9 
 
 		 387 aa  724    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.34 
 
 		 387 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.18 
 
 		 387 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  89.92 
 
 		 387 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.18 
 
 		 391 aa  616  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.24 
 
 		 387 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.16 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.39 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.87 
 
 		 386 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.42 
 
 		 387 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.42 
 
 		 387 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.42 
 
 		 387 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.42 
 
 		 387 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  73.9 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.82 
 
 		 374 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.9 
 
 		 387 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  73.9 
 
 		 387 aa  594  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.9 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.39 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.9 
 
 		 387 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.64 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.64 
 
 		 387 aa  591  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.09 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.39 
 
 		 387 aa  591  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.64 
 
 		 386 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.13 
 
 		 387 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  73.13 
 
 		 387 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.8 
 
 		 387 aa  584  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.83 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.83 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.83 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.03 
 
 		 387 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.51 
 
 		 387 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.58 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.91 
 
 		 390 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.35 
 
 		 391 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.84 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.1 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.58 
 
 		 391 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.06 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.06 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.36 
 
 		 390 aa  529  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.06 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.32 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.32 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.32 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.06 
 
 		 391 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.1 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  67.27 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.03 
 
 		 392 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.21 
 
 		 391 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  50.86 
 
 		 402 aa  352  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.78 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.78 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.03 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.9 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.78 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 390 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  47.26 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.21 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.63 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 394 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 		 402 aa  325  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.72 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.77 
 
 		 402 aa  325  9e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.82 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.29 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 		 378 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.57 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.78 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.11 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  45.19 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.1 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.52 
 
 		 401 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.06 
 
 		 412 aa  318  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 385 aa  318  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.32 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.45 
 
 		 405 aa  309  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>