264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0026 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
301 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  96.01 
 
 
301 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85129e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  95.68 
 
 
301 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  95.68 
 
 
301 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.39617e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  95.68 
 
 
301 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  96.01 
 
 
301 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  95.68 
 
 
301 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  96.01 
 
 
301 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87933e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  96.01 
 
 
301 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  96.01 
 
 
301 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  93.36 
 
 
301 aa  603  1e-172  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  93.02 
 
 
301 aa  601  1e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  90.7 
 
 
301 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  89.55 
 
 
287 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  86.29 
 
 
301 aa  554  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  85.52 
 
 
309 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  85.57 
 
 
304 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  87.8 
 
 
287 aa  550  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  88.15 
 
 
287 aa  547  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78552e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.9 
 
 
303 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  85.57 
 
 
301 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.23 
 
 
303 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.23 
 
 
304 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.23 
 
 
302 aa  544  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  85.23 
 
 
304 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.56 
 
 
303 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.89 
 
 
304 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.56 
 
 
304 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.56 
 
 
304 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.56 
 
 
304 aa  542  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2498  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  85.23 
 
 
330 aa  538  1e-152  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0005  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  82.27 
 
 
311 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1232  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  80.07 
 
 
303 aa  521  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2964  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.23 
 
 
310 aa  522  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.95 
 
 
305 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001999  glycyl-tRNA synthetase alpha chain  83.61 
 
 
305 aa  515  1e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.64 
 
 
364 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.91 
 
 
315 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  77.67 
 
 
308 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.79 
 
 
323 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.23 
 
 
317 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.57 
 
 
318 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.36 
 
 
308 aa  494  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.57 
 
 
315 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.18 
 
 
315 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.51 
 
 
306 aa  491  1e-138  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.57 
 
 
315 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.78016e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.57 
 
 
315 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.23 
 
 
315 aa  491  1e-138  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  1.12208e-10 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.89 
 
 
315 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  8.95825e-12 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.59 
 
 
318 aa  487  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.55 
 
 
309 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.87 
 
 
335 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  77.21 
 
 
315 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.08 
 
 
317 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.08 
 
 
329 aa  481  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.53 
 
 
303 aa  478  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.16 
 
 
350 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03831  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.87 
 
 
302 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.95 
 
 
314 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.72 
 
 
319 aa  471  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.25 
 
 
317 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.72 
 
 
319 aa  471  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  75.09 
 
 
314 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.49 
 
 
307 aa  469  1e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0761934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0888  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.49 
 
 
307 aa  469  1e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.4 
 
 
317 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.4 
 
 
317 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1805  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.4 
 
 
301 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.4 
 
 
301 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0161  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.43 
 
 
302 aa  457  1e-128  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.32 
 
 
312 aa  458  1e-128  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.13 
 
 
304 aa  454  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.32 
 
 
308 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.63 
 
 
301 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.6 
 
 
327 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.6 
 
 
301 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.11 
 
 
308 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.29 
 
 
314 aa  451  1e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.6 
 
 
328 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.47 
 
 
312 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.33 
 
 
294 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0448  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.39 
 
 
317 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.65 
 
 
296 aa  446  1e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0509  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.51 
 
 
322 aa  447  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00315441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.26 
 
 
325 aa  447  1e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0406  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.33 
 
 
335 aa  446  1e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.995928  normal  0.36561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6028  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70 
 
 
334 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.042164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>