277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0024 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  100 
 
 
351 aa  715  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  55.62 
 
 
347 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  55.62 
 
 
347 aa  407  1e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  7.36166e-09 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  56.2 
 
 
347 aa  406  1e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.89797e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  57.35 
 
 
346 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  6.19076e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  57.64 
 
 
346 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  57.64 
 
 
346 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  57.35 
 
 
346 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  53.98 
 
 
348 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  53.6 
 
 
354 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  55.74 
 
 
351 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60962e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  52.44 
 
 
350 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  57.77 
 
 
334 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  7.2807e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  60.15 
 
 
266 aa  342  6e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
384 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  28.57 
 
 
366 aa  129  1e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  30.8 
 
 
324 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  27.94 
 
 
358 aa  80.5  4e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.24 
 
 
397 aa  79.3  8e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
300 aa  79  1e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 
298 aa  78.6  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
297 aa  77.8  3e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.49 
 
 
303 aa  77.4  4e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  34.33 
 
 
292 aa  75.5  1e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.23 
 
 
297 aa  75.9  1e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
349 aa  75.1  2e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.5 
 
 
287 aa  74.3  3e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  74.3  3e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.51 
 
 
289 aa  73.6  5e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 
412 aa  73.6  5e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
283 aa  73.2  6e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  28.19 
 
 
274 aa  73.2  6e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
353 aa  72.8  8e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
283 aa  72.8  8e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  35.42 
 
 
281 aa  72.8  8e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 
371 aa  72.4  1e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 
297 aa  71.2  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  3.64844e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  23.3 
 
 
283 aa  71.6  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 
430 aa  70.9  4e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  31.15 
 
 
278 aa  70.5  4e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
297 aa  70.5  4e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  28.06 
 
 
288 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
290 aa  70.1  6e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25 
 
 
271 aa  69.3  9e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  29.08 
 
 
290 aa  69.3  9e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.99 
 
 
352 aa  69.3  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  29.08 
 
 
290 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  24.57 
 
 
399 aa  68.9  1e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
440 aa  68.9  1e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  30.05 
 
 
256 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.47 
 
 
288 aa  68.2  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.26 
 
 
280 aa  68.2  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  21.67 
 
 
427 aa  67.8  3e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
406 aa  67.8  3e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 
410 aa  67.4  4e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
286 aa  67.4  4e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25 
 
 
288 aa  66.6  6e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.04 
 
 
292 aa  66.2  8e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
281 aa  66.2  9e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 
279 aa  65.9  9e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  26.94 
 
 
274 aa  65.5  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  31.43 
 
 
280 aa  65.5  1e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 
290 aa  65.9  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  24.28 
 
 
279 aa  65.9  1e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26 
 
 
287 aa  65.5  1e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
288 aa  65.5  1e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
285 aa  65.5  1e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
289 aa  65.5  1e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.67 
 
 
730 aa  65.1  2e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 
282 aa  64.3  3e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  23.46 
 
 
280 aa  63.9  4e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
287 aa  63.9  4e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  23.19 
 
 
291 aa  63.9  4e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  30.15 
 
 
297 aa  63.9  4e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.41 
 
 
293 aa  63.9  4e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
283 aa  63.5  5e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.08 
 
 
716 aa  63.5  5e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  32.23 
 
 
302 aa  63.5  6e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  26.46 
 
 
277 aa  63.2  7e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
299 aa  62.8  8e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  22.43 
 
 
718 aa  62.8  9e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  26.94 
 
 
397 aa  62.4  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
283 aa  62.4  1e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
298 aa  62.4  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 
297 aa  62  1e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 
284 aa  62.4  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
284 aa  62  1e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.85116e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  24.88 
 
 
274 aa  62  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 
283 aa  62  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
299 aa  62  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.78316e-11 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.28 
 
 
696 aa  61.2  2e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.46 
 
 
275 aa  62  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
280 aa  61.6  2e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.85 
 
 
304 aa  61.6  2e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.7 
 
 
289 aa  61.2  2e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 
282 aa  62  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  25.87 
 
 
287 aa  61.2  3e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  27.31 
 
 
332 aa  61.2  3e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  23.87 
 
 
280 aa  60.5  4e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  22.41 
 
 
291 aa  60.1  5e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>