More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0017 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  100 
 
 
133 aa  277  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  68.89 
 
 
135 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  64.14 
 
 
145 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
135 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  64.14 
 
 
145 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  66.17 
 
 
133 aa  183  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
135 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  62.25 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  67.91 
 
 
134 aa  180  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  64.93 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  64.14 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  61.04 
 
 
154 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  57.66 
 
 
137 aa  156  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  39.13 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  36.96 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  38.04 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  36.26 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  36.96 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  33.6 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  36.96 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  36.96 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  36.96 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  36.96 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  31.62 
 
 
162 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.51 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  34.69 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  38.89 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  41.27 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  30.91 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  38.89 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  38.89 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.75 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  41.18 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
169 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30.15 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  36.36 
 
 
530 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  37.88 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  47.37 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  37.88 
 
 
147 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
102 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  39.39 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  37.88 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  37.88 
 
 
147 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  43.75 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  43.75 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  33 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  32.63 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
155 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  32.33 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  40 
 
 
142 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
174 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  37.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  31.87 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
156 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3150  phosphohydrolase  45.61 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.696001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  49.06 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  31.87 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  49.06 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  28.77 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  36.36 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.67 
 
 
175 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  47.37 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  45.45 
 
 
167 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  47.37 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.67 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>